Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC3Q9BQ90 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC3Q9BQ90 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC3Q9BQ90 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC3Q9BQ90 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHDC3Q9BQ90 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHDC3Q9BQ90 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHDC3Q9BQ90 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHDC3Q9BQ90 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHDC3Q9BQ90 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHDC3Q9BQ90 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHDC3Q9BQ90 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHDC3Q9BQ90 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC3Q9BQ90 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC3Q9BQ90 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC3Q9BQ90 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC3Q9BQ90 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC3Q9BQ90 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC3Q9BQ90 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC3Q9BQ90 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC3Q9BQ90 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC3Q9BQ90 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC3Q9BQ90 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC3Q9BQ90 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC3Q9BQ90 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC3Q9BQ90 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC3Q9BQ90 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC3Q9BQ90 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC3Q9BQ90 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC3Q9BQ90 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC3Q9BQ90 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC3Q9BQ90 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC3Q9BQ90 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC3Q9BQ90 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC3Q9BQ90 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHDC3Q9BQ90 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHDC3Q9BQ90 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHDC3Q9BQ90 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC3Q9BQ90 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHDC3Q9BQ90 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHDC3Q9BQ90 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHDC3Q9BQ90 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHDC3Q9BQ90 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHDC3Q9BQ90 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHDC3Q9BQ90 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHDC3Q9BQ90 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHDC3Q9BQ90 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC3Q9BQ90 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC3Q9BQ90 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC3Q9BQ90 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC3Q9BQ90 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC3Q9BQ90 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHDC3Q9BQ90 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHDC3Q9BQ90 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHDC3Q9BQ90 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC3Q9BQ90 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC3Q9BQ90 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC3Q9BQ90 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC3Q9BQ90 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC3Q9BQ90 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC3Q9BQ90 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC3Q9BQ90 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC3Q9BQ90 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC3Q9BQ90 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC3Q9BQ90 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC3Q9BQ90 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC3Q9BQ90 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC3Q9BQ90 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC3Q9BQ90 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC3Q9BQ90 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC3Q9BQ90 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC3Q9BQ90 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC3Q9BQ90 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC3Q9BQ90 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC3Q9BQ90 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC3Q9BQ90 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC3Q9BQ90 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC3Q9BQ90 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC3Q9BQ90 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC3Q9BQ90 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC3Q9BQ90 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC3Q9BQ90 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHDC3Q9BQ90 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC3Q9BQ90 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC3Q9BQ90 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC3Q9BQ90 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC3Q9BQ90 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC3Q9BQ90 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC3Q9BQ90 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC3Q9BQ90 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC3Q9BQ90 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC3Q9BQ90 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC3Q9BQ90 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC3Q9BQ90 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC3Q9BQ90 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC3Q9BQ90 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC3Q9BQ90 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHDC3Q9BQ90 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC3Q9BQ90 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms