Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUDCD1Q96RS6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUDCD1Q96RS6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUDCD1Q96RS6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCD1Q96RS6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCD1Q96RS6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NUDCD1Q96RS6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUDCD1Q96RS6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUDCD1Q96RS6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDCD1Q96RS6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDCD1Q96RS6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDCD1Q96RS6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUDCD1Q96RS6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUDCD1Q96RS6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUDCD1Q96RS6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NUDCD1Q96RS6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUDCD1Q96RS6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUDCD1Q96RS6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NUDCD1Q96RS6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCD1Q96RS6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCD1Q96RS6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCD1Q96RS6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCD1Q96RS6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUDCD1Q96RS6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUDCD1Q96RS6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUDCD1Q96RS6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUDCD1Q96RS6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUDCD1Q96RS6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUDCD1Q96RS6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCD1Q96RS6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUDCD1Q96RS6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUDCD1Q96RS6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUDCD1Q96RS6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUDCD1Q96RS6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDCD1Q96RS6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDCD1Q96RS6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDCD1Q96RS6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUDCD1Q96RS6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUDCD1Q96RS6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUDCD1Q96RS6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUDCD1Q96RS6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDCD1Q96RS6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUDCD1Q96RS6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUDCD1Q96RS6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NUDCD1Q96RS6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUDCD1Q96RS6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUDCD1Q96RS6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUDCD1Q96RS6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NUDCD1Q96RS6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NUDCD1Q96RS6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCD1Q96RS6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCD1Q96RS6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCD1Q96RS6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCD1Q96RS6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NUDCD1Q96RS6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NUDCD1Q96RS6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUDCD1Q96RS6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUDCD1Q96RS6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCD1Q96RS6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCD1Q96RS6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCD1Q96RS6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDCD1Q96RS6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDCD1Q96RS6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUDCD1Q96RS6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDCD1Q96RS6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDCD1Q96RS6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUDCD1Q96RS6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUDCD1Q96RS6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUDCD1Q96RS6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUDCD1Q96RS6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUDCD1Q96RS6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUDCD1Q96RS6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCD1Q96RS6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCD1Q96RS6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCD1Q96RS6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUDCD1Q96RS6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUDCD1Q96RS6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUDCD1Q96RS6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUDCD1Q96RS6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCD1Q96RS6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUDCD1Q96RS6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUDCD1Q96RS6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUDCD1Q96RS6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUDCD1Q96RS6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUDCD1Q96RS6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NUDCD1Q96RS6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUDCD1Q96RS6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUDCD1Q96RS6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDCD1Q96RS6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDCD1Q96RS6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCD1Q96RS6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NUDCD1Q96RS6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCD1Q96RS6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCD1Q96RS6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCD1Q96RS6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCD1Q96RS6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDCD1Q96RS6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDCD1Q96RS6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDCD1Q96RS6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUDCD1Q96RS6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms