Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TGS1Q96RS0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TGS1Q96RS0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TGS1Q96RS0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TGS1Q96RS0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TGS1Q96RS0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TGS1Q96RS0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TGS1Q96RS0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TGS1Q96RS0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TGS1Q96RS0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TGS1Q96RS0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TGS1Q96RS0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TGS1Q96RS0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TGS1Q96RS0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TGS1Q96RS0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TGS1Q96RS0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TGS1Q96RS0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TGS1Q96RS0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TGS1Q96RS0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TGS1Q96RS0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TGS1Q96RS0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TGS1Q96RS0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TGS1Q96RS0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TGS1Q96RS0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TGS1Q96RS0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TGS1Q96RS0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TGS1Q96RS0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TGS1Q96RS0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TGS1Q96RS0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TGS1Q96RS0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TGS1Q96RS0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TGS1Q96RS0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TGS1Q96RS0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TGS1Q96RS0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TGS1Q96RS0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TGS1Q96RS0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TGS1Q96RS0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TGS1Q96RS0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TGS1Q96RS0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TGS1Q96RS0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TGS1Q96RS0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TGS1Q96RS0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TGS1Q96RS0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TGS1Q96RS0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TGS1Q96RS0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TGS1Q96RS0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TGS1Q96RS0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TGS1Q96RS0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TGS1Q96RS0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TGS1Q96RS0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TGS1Q96RS0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TGS1Q96RS0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TGS1Q96RS0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TGS1Q96RS0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TGS1Q96RS0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TGS1Q96RS0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TGS1Q96RS0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TGS1Q96RS0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TGS1Q96RS0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TGS1Q96RS0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TGS1Q96RS0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TGS1Q96RS0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TGS1Q96RS0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TGS1Q96RS0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TGS1Q96RS0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TGS1Q96RS0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TGS1Q96RS0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TGS1Q96RS0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TGS1Q96RS0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TGS1Q96RS0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TGS1Q96RS0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TGS1Q96RS0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TGS1Q96RS0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TGS1Q96RS0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TGS1Q96RS0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TGS1Q96RS0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TGS1Q96RS0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TGS1Q96RS0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TGS1Q96RS0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TGS1Q96RS0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TGS1Q96RS0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TGS1Q96RS0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TGS1Q96RS0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TGS1Q96RS0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TGS1Q96RS0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TGS1Q96RS0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TGS1Q96RS0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TGS1Q96RS0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TGS1Q96RS0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TGS1Q96RS0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TGS1Q96RS0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TGS1Q96RS0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TGS1Q96RS0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TGS1Q96RS0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TGS1Q96RS0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TGS1Q96RS0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TGS1Q96RS0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TGS1Q96RS0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TGS1Q96RS0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TGS1Q96RS0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.2 ms