Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
ARAP1Q96P48 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
ARAP1Q96P48 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
ARAP1Q96P48 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
ARAP1Q96P48 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC45.49■■■■■ 4.87
ARAP1Q96P48 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC45.48■■■■■ 4.87
ARAP1Q96P48 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
ARAP1Q96P48 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
ARAP1Q96P48 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
ARAP1Q96P48 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
ARAP1Q96P48 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC45.4■■■■■ 4.86
ARAP1Q96P48 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.39■■■■■ 4.86
ARAP1Q96P48 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.86
ARAP1Q96P48 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
ARAP1Q96P48 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
ARAP1Q96P48 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
ARAP1Q96P48 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
ARAP1Q96P48 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
ARAP1Q96P48 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
ARAP1Q96P48 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
ARAP1Q96P48 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
ARAP1Q96P48 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
ARAP1Q96P48 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
ARAP1Q96P48 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
ARAP1Q96P48 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
ARAP1Q96P48 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC45.21■■■■■ 4.83
ARAP1Q96P48 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC45.21■■■■■ 4.83
ARAP1Q96P48 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC45.21■■■■■ 4.83
ARAP1Q96P48 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
ARAP1Q96P48 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
ARAP1Q96P48 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
ARAP1Q96P48 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
ARAP1Q96P48 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
ARAP1Q96P48 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
ARAP1Q96P48 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC45.17■■■■■ 4.82
ARAP1Q96P48 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
ARAP1Q96P48 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
ARAP1Q96P48 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
ARAP1Q96P48 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC45.04■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC45.02■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC45.01■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
ARAP1Q96P48 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
ARAP1Q96P48 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
ARAP1Q96P48 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
ARAP1Q96P48 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
ARAP1Q96P48 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
ARAP1Q96P48 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC44.9■■■■■ 4.78
ARAP1Q96P48 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC44.89■■■■■ 4.78
ARAP1Q96P48 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
ARAP1Q96P48 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
ARAP1Q96P48 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC44.88■■■■■ 4.78
ARAP1Q96P48 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
ARAP1Q96P48 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
ARAP1Q96P48 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
ARAP1Q96P48 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
ARAP1Q96P48 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC44.83■■■■■ 4.77
ARAP1Q96P48 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.82■■■■■ 4.77
ARAP1Q96P48 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
ARAP1Q96P48 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
ARAP1Q96P48 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC44.8■■■■■ 4.76
ARAP1Q96P48 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
ARAP1Q96P48 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
ARAP1Q96P48 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
ARAP1Q96P48 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
ARAP1Q96P48 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC44.74■■■■■ 4.75
ARAP1Q96P48 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
ARAP1Q96P48 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
ARAP1Q96P48 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
ARAP1Q96P48 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
ARAP1Q96P48 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
ARAP1Q96P48 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC44.72■■■■■ 4.75
ARAP1Q96P48 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
ARAP1Q96P48 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
ARAP1Q96P48 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
ARAP1Q96P48 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC44.69■■■■■ 4.74
ARAP1Q96P48 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC44.69■■■■■ 4.74
ARAP1Q96P48 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC44.69■■■■■ 4.74
ARAP1Q96P48 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
ARAP1Q96P48 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC44.65■■■■■ 4.74
ARAP1Q96P48 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms