Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD11Q96NU1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD11Q96NU1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SAMD11Q96NU1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD11Q96NU1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SAMD11Q96NU1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SAMD11Q96NU1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SAMD11Q96NU1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SAMD11Q96NU1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SAMD11Q96NU1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SAMD11Q96NU1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SAMD11Q96NU1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SAMD11Q96NU1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SAMD11Q96NU1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SAMD11Q96NU1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SAMD11Q96NU1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SAMD11Q96NU1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SAMD11Q96NU1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SAMD11Q96NU1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SAMD11Q96NU1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SAMD11Q96NU1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SAMD11Q96NU1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SAMD11Q96NU1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SAMD11Q96NU1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SAMD11Q96NU1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SAMD11Q96NU1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SAMD11Q96NU1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SAMD11Q96NU1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD11Q96NU1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD11Q96NU1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD11Q96NU1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD11Q96NU1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SAMD11Q96NU1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SAMD11Q96NU1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD11Q96NU1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD11Q96NU1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD11Q96NU1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SAMD11Q96NU1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SAMD11Q96NU1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SAMD11Q96NU1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SAMD11Q96NU1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SAMD11Q96NU1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SAMD11Q96NU1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SAMD11Q96NU1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SAMD11Q96NU1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SAMD11Q96NU1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SAMD11Q96NU1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SAMD11Q96NU1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SAMD11Q96NU1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SAMD11Q96NU1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SAMD11Q96NU1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SAMD11Q96NU1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SAMD11Q96NU1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SAMD11Q96NU1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SAMD11Q96NU1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SAMD11Q96NU1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SAMD11Q96NU1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SAMD11Q96NU1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SAMD11Q96NU1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SAMD11Q96NU1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SAMD11Q96NU1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SAMD11Q96NU1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SAMD11Q96NU1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SAMD11Q96NU1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SAMD11Q96NU1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SAMD11Q96NU1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SAMD11Q96NU1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SAMD11Q96NU1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SAMD11Q96NU1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SAMD11Q96NU1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SAMD11Q96NU1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SAMD11Q96NU1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SAMD11Q96NU1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SAMD11Q96NU1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SAMD11Q96NU1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SAMD11Q96NU1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SAMD11Q96NU1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SAMD11Q96NU1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SAMD11Q96NU1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SAMD11Q96NU1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SAMD11Q96NU1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SAMD11Q96NU1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SAMD11Q96NU1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SAMD11Q96NU1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SAMD11Q96NU1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SAMD11Q96NU1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SAMD11Q96NU1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SAMD11Q96NU1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SAMD11Q96NU1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SAMD11Q96NU1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SAMD11Q96NU1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SAMD11Q96NU1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SAMD11Q96NU1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SAMD11Q96NU1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SAMD11Q96NU1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SAMD11Q96NU1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SAMD11Q96NU1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SAMD11Q96NU1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SAMD11Q96NU1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SAMD11Q96NU1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms