Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM8Q96KF7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM8Q96KF7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM8Q96KF7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM8Q96KF7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM8Q96KF7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM8Q96KF7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM8Q96KF7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM8Q96KF7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM8Q96KF7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM8Q96KF7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM8Q96KF7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM8Q96KF7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM8Q96KF7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM8Q96KF7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM8Q96KF7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM8Q96KF7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM8Q96KF7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM8Q96KF7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM8Q96KF7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM8Q96KF7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM8Q96KF7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM8Q96KF7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM8Q96KF7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM8Q96KF7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM8Q96KF7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM8Q96KF7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM8Q96KF7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM8Q96KF7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM8Q96KF7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM8Q96KF7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM8Q96KF7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM8Q96KF7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM8Q96KF7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM8Q96KF7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM8Q96KF7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM8Q96KF7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM8Q96KF7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM8Q96KF7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM8Q96KF7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM8Q96KF7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM8Q96KF7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM8Q96KF7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM8Q96KF7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM8Q96KF7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM8Q96KF7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM8Q96KF7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM8Q96KF7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM8Q96KF7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM8Q96KF7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM8Q96KF7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM8Q96KF7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM8Q96KF7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM8Q96KF7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM8Q96KF7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM8Q96KF7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM8Q96KF7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM8Q96KF7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM8Q96KF7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM8Q96KF7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM8Q96KF7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SMIM8Q96KF7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM8Q96KF7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM8Q96KF7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM8Q96KF7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM8Q96KF7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM8Q96KF7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM8Q96KF7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM8Q96KF7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM8Q96KF7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM8Q96KF7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM8Q96KF7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM8Q96KF7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM8Q96KF7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM8Q96KF7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMIM8Q96KF7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM8Q96KF7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM8Q96KF7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM8Q96KF7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM8Q96KF7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM8Q96KF7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM8Q96KF7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM8Q96KF7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM8Q96KF7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM8Q96KF7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM8Q96KF7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM8Q96KF7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM8Q96KF7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM8Q96KF7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM8Q96KF7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM8Q96KF7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM8Q96KF7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms