Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC97Q96F63 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC97Q96F63 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC97Q96F63 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC97Q96F63 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC97Q96F63 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC97Q96F63 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC97Q96F63 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC97Q96F63 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC97Q96F63 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC97Q96F63 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC97Q96F63 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC97Q96F63 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC97Q96F63 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC97Q96F63 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC97Q96F63 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC97Q96F63 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC97Q96F63 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC97Q96F63 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC97Q96F63 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC97Q96F63 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC97Q96F63 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC97Q96F63 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC97Q96F63 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC97Q96F63 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC97Q96F63 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC97Q96F63 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC97Q96F63 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC97Q96F63 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC97Q96F63 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC97Q96F63 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC97Q96F63 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC97Q96F63 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC97Q96F63 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC97Q96F63 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC97Q96F63 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC97Q96F63 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC97Q96F63 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC97Q96F63 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC97Q96F63 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC97Q96F63 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC97Q96F63 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC97Q96F63 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC97Q96F63 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC97Q96F63 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC97Q96F63 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC97Q96F63 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC97Q96F63 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC97Q96F63 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC97Q96F63 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC97Q96F63 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC97Q96F63 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC97Q96F63 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC97Q96F63 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC97Q96F63 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC97Q96F63 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC97Q96F63 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC97Q96F63 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC97Q96F63 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC97Q96F63 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC97Q96F63 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC97Q96F63 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC97Q96F63 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC97Q96F63 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC97Q96F63 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC97Q96F63 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC97Q96F63 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC97Q96F63 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC97Q96F63 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC97Q96F63 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC97Q96F63 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC97Q96F63 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC97Q96F63 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC97Q96F63 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC97Q96F63 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC97Q96F63 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC97Q96F63 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC97Q96F63 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC97Q96F63 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC97Q96F63 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC97Q96F63 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC97Q96F63 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC97Q96F63 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC97Q96F63 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC97Q96F63 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC97Q96F63 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC97Q96F63 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC97Q96F63 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC97Q96F63 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC97Q96F63 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC97Q96F63 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC97Q96F63 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC97Q96F63 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC97Q96F63 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC97Q96F63 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC97Q96F63 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC97Q96F63 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC97Q96F63 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC97Q96F63 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC97Q96F63 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms