Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf43Q96C57 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf43Q96C57 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf43Q96C57 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf43Q96C57 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf43Q96C57 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf43Q96C57 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf43Q96C57 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf43Q96C57 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf43Q96C57 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf43Q96C57 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C12orf43Q96C57 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C12orf43Q96C57 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C12orf43Q96C57 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C12orf43Q96C57 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C12orf43Q96C57 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf43Q96C57 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf43Q96C57 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf43Q96C57 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C12orf43Q96C57 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C12orf43Q96C57 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf43Q96C57 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf43Q96C57 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf43Q96C57 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf43Q96C57 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf43Q96C57 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf43Q96C57 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf43Q96C57 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf43Q96C57 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf43Q96C57 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf43Q96C57 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf43Q96C57 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf43Q96C57 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf43Q96C57 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf43Q96C57 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf43Q96C57 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf43Q96C57 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf43Q96C57 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C12orf43Q96C57 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf43Q96C57 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf43Q96C57 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf43Q96C57 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf43Q96C57 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf43Q96C57 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf43Q96C57 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf43Q96C57 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf43Q96C57 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf43Q96C57 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf43Q96C57 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf43Q96C57 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf43Q96C57 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf43Q96C57 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C12orf43Q96C57 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C12orf43Q96C57 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C12orf43Q96C57 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C12orf43Q96C57 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf43Q96C57 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf43Q96C57 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf43Q96C57 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf43Q96C57 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C12orf43Q96C57 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C12orf43Q96C57 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C12orf43Q96C57 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C12orf43Q96C57 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C12orf43Q96C57 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C12orf43Q96C57 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C12orf43Q96C57 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C12orf43Q96C57 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C12orf43Q96C57 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C12orf43Q96C57 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C12orf43Q96C57 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C12orf43Q96C57 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C12orf43Q96C57 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C12orf43Q96C57 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C12orf43Q96C57 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C12orf43Q96C57 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C12orf43Q96C57 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C12orf43Q96C57 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C12orf43Q96C57 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C12orf43Q96C57 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C12orf43Q96C57 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C12orf43Q96C57 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf43Q96C57 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf43Q96C57 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf43Q96C57 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf43Q96C57 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf43Q96C57 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf43Q96C57 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf43Q96C57 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf43Q96C57 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf43Q96C57 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf43Q96C57 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms