Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3KBP1Q96B97 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3KBP1Q96B97 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3KBP1Q96B97 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SH3KBP1Q96B97 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SH3KBP1Q96B97 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH3KBP1Q96B97 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3KBP1Q96B97 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3KBP1Q96B97 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3KBP1Q96B97 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3KBP1Q96B97 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3KBP1Q96B97 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SH3KBP1Q96B97 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SH3KBP1Q96B97 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SH3KBP1Q96B97 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3KBP1Q96B97 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3KBP1Q96B97 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3KBP1Q96B97 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH3KBP1Q96B97 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3KBP1Q96B97 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3KBP1Q96B97 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3KBP1Q96B97 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3KBP1Q96B97 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3KBP1Q96B97 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3KBP1Q96B97 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3KBP1Q96B97 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3KBP1Q96B97 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3KBP1Q96B97 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3KBP1Q96B97 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3KBP1Q96B97 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3KBP1Q96B97 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3KBP1Q96B97 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3KBP1Q96B97 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3KBP1Q96B97 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3KBP1Q96B97 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3KBP1Q96B97 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3KBP1Q96B97 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3KBP1Q96B97 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3KBP1Q96B97 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3KBP1Q96B97 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH3KBP1Q96B97 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3KBP1Q96B97 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3KBP1Q96B97 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3KBP1Q96B97 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3KBP1Q96B97 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3KBP1Q96B97 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3KBP1Q96B97 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3KBP1Q96B97 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3KBP1Q96B97 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3KBP1Q96B97 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3KBP1Q96B97 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3KBP1Q96B97 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3KBP1Q96B97 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3KBP1Q96B97 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3KBP1Q96B97 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3KBP1Q96B97 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3KBP1Q96B97 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3KBP1Q96B97 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SH3KBP1Q96B97 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3KBP1Q96B97 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3KBP1Q96B97 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3KBP1Q96B97 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3KBP1Q96B97 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3KBP1Q96B97 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3KBP1Q96B97 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH3KBP1Q96B97 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH3KBP1Q96B97 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH3KBP1Q96B97 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3KBP1Q96B97 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3KBP1Q96B97 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3KBP1Q96B97 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH3KBP1Q96B97 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH3KBP1Q96B97 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SH3KBP1Q96B97 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3KBP1Q96B97 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3KBP1Q96B97 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3KBP1Q96B97 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3KBP1Q96B97 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3KBP1Q96B97 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3KBP1Q96B97 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3KBP1Q96B97 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms