Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC4Q8WW27 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC4Q8WW27 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC4Q8WW27 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC4Q8WW27 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC4Q8WW27 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC4Q8WW27 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC4Q8WW27 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC4Q8WW27 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC4Q8WW27 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC4Q8WW27 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBEC4Q8WW27 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC4Q8WW27 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC4Q8WW27 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC4Q8WW27 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC4Q8WW27 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC4Q8WW27 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOBEC4Q8WW27 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOBEC4Q8WW27 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOBEC4Q8WW27 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC4Q8WW27 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC4Q8WW27 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC4Q8WW27 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC4Q8WW27 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC4Q8WW27 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC4Q8WW27 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC4Q8WW27 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBEC4Q8WW27 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBEC4Q8WW27 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBEC4Q8WW27 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC4Q8WW27 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC4Q8WW27 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC4Q8WW27 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC4Q8WW27 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC4Q8WW27 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC4Q8WW27 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC4Q8WW27 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC4Q8WW27 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC4Q8WW27 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC4Q8WW27 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC4Q8WW27 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC4Q8WW27 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC4Q8WW27 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC4Q8WW27 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC4Q8WW27 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC4Q8WW27 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC4Q8WW27 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC4Q8WW27 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC4Q8WW27 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC4Q8WW27 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC4Q8WW27 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC4Q8WW27 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC4Q8WW27 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC4Q8WW27 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC4Q8WW27 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APOBEC4Q8WW27 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC4Q8WW27 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC4Q8WW27 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC4Q8WW27 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC4Q8WW27 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC4Q8WW27 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC4Q8WW27 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC4Q8WW27 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC4Q8WW27 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC4Q8WW27 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC4Q8WW27 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC4Q8WW27 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC4Q8WW27 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC4Q8WW27 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC4Q8WW27 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC4Q8WW27 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC4Q8WW27 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC4Q8WW27 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC4Q8WW27 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC4Q8WW27 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC4Q8WW27 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC4Q8WW27 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC4Q8WW27 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC4Q8WW27 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC4Q8WW27 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC4Q8WW27 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC4Q8WW27 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.9 ms