Protein–RNA interactions for Protein: Q8TER0

SNED1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNED1Q8TER0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNED1Q8TER0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNED1Q8TER0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNED1Q8TER0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNED1Q8TER0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
SNED1Q8TER0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SNED1Q8TER0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SNED1Q8TER0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SNED1Q8TER0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SNED1Q8TER0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNED1Q8TER0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNED1Q8TER0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNED1Q8TER0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SNED1Q8TER0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNED1Q8TER0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNED1Q8TER0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNED1Q8TER0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNED1Q8TER0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNED1Q8TER0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNED1Q8TER0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SNED1Q8TER0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SNED1Q8TER0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SNED1Q8TER0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SNED1Q8TER0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SNED1Q8TER0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SNED1Q8TER0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SNED1Q8TER0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SNED1Q8TER0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SNED1Q8TER0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SNED1Q8TER0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SNED1Q8TER0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SNED1Q8TER0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SNED1Q8TER0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SNED1Q8TER0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SNED1Q8TER0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNED1Q8TER0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNED1Q8TER0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNED1Q8TER0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SNED1Q8TER0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SNED1Q8TER0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
SNED1Q8TER0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SNED1Q8TER0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SNED1Q8TER0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SNED1Q8TER0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SNED1Q8TER0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SNED1Q8TER0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SNED1Q8TER0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms