Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC41

RNF217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF217Q8TC41 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF217Q8TC41 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF217Q8TC41 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF217Q8TC41 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF217Q8TC41 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF217Q8TC41 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF217Q8TC41 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF217Q8TC41 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF217Q8TC41 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF217Q8TC41 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF217Q8TC41 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF217Q8TC41 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF217Q8TC41 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF217Q8TC41 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF217Q8TC41 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF217Q8TC41 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF217Q8TC41 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF217Q8TC41 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF217Q8TC41 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF217Q8TC41 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF217Q8TC41 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF217Q8TC41 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF217Q8TC41 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF217Q8TC41 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF217Q8TC41 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF217Q8TC41 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF217Q8TC41 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF217Q8TC41 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF217Q8TC41 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF217Q8TC41 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF217Q8TC41 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF217Q8TC41 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF217Q8TC41 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF217Q8TC41 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF217Q8TC41 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF217Q8TC41 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF217Q8TC41 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF217Q8TC41 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF217Q8TC41 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF217Q8TC41 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF217Q8TC41 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF217Q8TC41 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF217Q8TC41 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF217Q8TC41 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF217Q8TC41 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF217Q8TC41 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF217Q8TC41 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF217Q8TC41 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF217Q8TC41 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF217Q8TC41 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF217Q8TC41 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF217Q8TC41 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF217Q8TC41 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF217Q8TC41 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF217Q8TC41 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF217Q8TC41 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF217Q8TC41 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF217Q8TC41 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF217Q8TC41 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF217Q8TC41 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF217Q8TC41 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF217Q8TC41 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF217Q8TC41 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF217Q8TC41 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF217Q8TC41 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF217Q8TC41 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF217Q8TC41 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF217Q8TC41 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF217Q8TC41 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF217Q8TC41 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF217Q8TC41 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF217Q8TC41 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF217Q8TC41 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF217Q8TC41 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF217Q8TC41 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF217Q8TC41 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF217Q8TC41 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF217Q8TC41 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF217Q8TC41 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF217Q8TC41 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF217Q8TC41 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF217Q8TC41 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF217Q8TC41 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF217Q8TC41 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF217Q8TC41 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF217Q8TC41 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF217Q8TC41 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF217Q8TC41 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF217Q8TC41 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF217Q8TC41 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF217Q8TC41 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF217Q8TC41 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF217Q8TC41 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF217Q8TC41 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF217Q8TC41 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF217Q8TC41 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF217Q8TC41 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF217Q8TC41 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF217Q8TC41 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF217Q8TC41 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms