Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE28

STKLD1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STKLD1Q8NE28 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STKLD1Q8NE28 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STKLD1Q8NE28 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
STKLD1Q8NE28 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STKLD1Q8NE28 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STKLD1Q8NE28 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STKLD1Q8NE28 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
STKLD1Q8NE28 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
STKLD1Q8NE28 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STKLD1Q8NE28 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STKLD1Q8NE28 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STKLD1Q8NE28 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STKLD1Q8NE28 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
STKLD1Q8NE28 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
STKLD1Q8NE28 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STKLD1Q8NE28 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STKLD1Q8NE28 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STKLD1Q8NE28 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
STKLD1Q8NE28 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
STKLD1Q8NE28 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STKLD1Q8NE28 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STKLD1Q8NE28 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STKLD1Q8NE28 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STKLD1Q8NE28 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
STKLD1Q8NE28 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STKLD1Q8NE28 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STKLD1Q8NE28 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STKLD1Q8NE28 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
STKLD1Q8NE28 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STKLD1Q8NE28 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STKLD1Q8NE28 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STKLD1Q8NE28 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STKLD1Q8NE28 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STKLD1Q8NE28 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STKLD1Q8NE28 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STKLD1Q8NE28 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STKLD1Q8NE28 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STKLD1Q8NE28 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STKLD1Q8NE28 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STKLD1Q8NE28 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STKLD1Q8NE28 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STKLD1Q8NE28 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STKLD1Q8NE28 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STKLD1Q8NE28 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STKLD1Q8NE28 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STKLD1Q8NE28 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STKLD1Q8NE28 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STKLD1Q8NE28 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STKLD1Q8NE28 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
STKLD1Q8NE28 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
STKLD1Q8NE28 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STKLD1Q8NE28 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
STKLD1Q8NE28 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STKLD1Q8NE28 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STKLD1Q8NE28 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
STKLD1Q8NE28 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STKLD1Q8NE28 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STKLD1Q8NE28 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STKLD1Q8NE28 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STKLD1Q8NE28 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STKLD1Q8NE28 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STKLD1Q8NE28 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STKLD1Q8NE28 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STKLD1Q8NE28 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STKLD1Q8NE28 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STKLD1Q8NE28 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STKLD1Q8NE28 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STKLD1Q8NE28 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STKLD1Q8NE28 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STKLD1Q8NE28 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STKLD1Q8NE28 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STKLD1Q8NE28 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STKLD1Q8NE28 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STKLD1Q8NE28 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STKLD1Q8NE28 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STKLD1Q8NE28 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STKLD1Q8NE28 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STKLD1Q8NE28 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STKLD1Q8NE28 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STKLD1Q8NE28 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STKLD1Q8NE28 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STKLD1Q8NE28 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STKLD1Q8NE28 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STKLD1Q8NE28 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STKLD1Q8NE28 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STKLD1Q8NE28 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STKLD1Q8NE28 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STKLD1Q8NE28 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STKLD1Q8NE28 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STKLD1Q8NE28 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STKLD1Q8NE28 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STKLD1Q8NE28 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STKLD1Q8NE28 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STKLD1Q8NE28 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STKLD1Q8NE28 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STKLD1Q8NE28 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STKLD1Q8NE28 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STKLD1Q8NE28 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STKLD1Q8NE28 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
STKLD1Q8NE28 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms