Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LINC00116Q8NCU8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LINC00116Q8NCU8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LINC00116Q8NCU8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LINC00116Q8NCU8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
LINC00116Q8NCU8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
LINC00116Q8NCU8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
LINC00116Q8NCU8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
LINC00116Q8NCU8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
LINC00116Q8NCU8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
LINC00116Q8NCU8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LINC00116Q8NCU8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
LINC00116Q8NCU8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
LINC00116Q8NCU8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LINC00116Q8NCU8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LINC00116Q8NCU8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
LINC00116Q8NCU8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.36■■■■□ 3.25
LINC00116Q8NCU8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LINC00116Q8NCU8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
LINC00116Q8NCU8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LINC00116Q8NCU8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
LINC00116Q8NCU8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
LINC00116Q8NCU8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
LINC00116Q8NCU8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LINC00116Q8NCU8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
LINC00116Q8NCU8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
LINC00116Q8NCU8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
LINC00116Q8NCU8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
LINC00116Q8NCU8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LINC00116Q8NCU8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LINC00116Q8NCU8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LINC00116Q8NCU8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LINC00116Q8NCU8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LINC00116Q8NCU8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LINC00116Q8NCU8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LINC00116Q8NCU8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LINC00116Q8NCU8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
LINC00116Q8NCU8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
LINC00116Q8NCU8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
LINC00116Q8NCU8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
LINC00116Q8NCU8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
LINC00116Q8NCU8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
LINC00116Q8NCU8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
LINC00116Q8NCU8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
LINC00116Q8NCU8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LINC00116Q8NCU8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LINC00116Q8NCU8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LINC00116Q8NCU8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LINC00116Q8NCU8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LINC00116Q8NCU8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LINC00116Q8NCU8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LINC00116Q8NCU8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
LINC00116Q8NCU8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
LINC00116Q8NCU8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
LINC00116Q8NCU8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
LINC00116Q8NCU8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
LINC00116Q8NCU8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
LINC00116Q8NCU8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
LINC00116Q8NCU8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
LINC00116Q8NCU8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LINC00116Q8NCU8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
LINC00116Q8NCU8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LINC00116Q8NCU8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LINC00116Q8NCU8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
LINC00116Q8NCU8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LINC00116Q8NCU8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
LINC00116Q8NCU8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LINC00116Q8NCU8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LINC00116Q8NCU8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LINC00116Q8NCU8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LINC00116Q8NCU8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LINC00116Q8NCU8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LINC00116Q8NCU8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LINC00116Q8NCU8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LINC00116Q8NCU8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LINC00116Q8NCU8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LINC00116Q8NCU8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
LINC00116Q8NCU8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LINC00116Q8NCU8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LINC00116Q8NCU8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
LINC00116Q8NCU8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
LINC00116Q8NCU8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LINC00116Q8NCU8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
LINC00116Q8NCU8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LINC00116Q8NCU8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
LINC00116Q8NCU8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LINC00116Q8NCU8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LINC00116Q8NCU8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LINC00116Q8NCU8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LINC00116Q8NCU8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
LINC00116Q8NCU8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LINC00116Q8NCU8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LINC00116Q8NCU8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
LINC00116Q8NCU8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
LINC00116Q8NCU8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
LINC00116Q8NCU8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
LINC00116Q8NCU8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
LINC00116Q8NCU8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.75■■■■□ 3.15
LINC00116Q8NCU8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LINC00116Q8NCU8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms