Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC33Q8N5R6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC33Q8N5R6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC33Q8N5R6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC33Q8N5R6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC33Q8N5R6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC33Q8N5R6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC33Q8N5R6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC33Q8N5R6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC33Q8N5R6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC33Q8N5R6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC33Q8N5R6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC33Q8N5R6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC33Q8N5R6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC33Q8N5R6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC33Q8N5R6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC33Q8N5R6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC33Q8N5R6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC33Q8N5R6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC33Q8N5R6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC33Q8N5R6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC33Q8N5R6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC33Q8N5R6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC33Q8N5R6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC33Q8N5R6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC33Q8N5R6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC33Q8N5R6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC33Q8N5R6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC33Q8N5R6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC33Q8N5R6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC33Q8N5R6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC33Q8N5R6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC33Q8N5R6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC33Q8N5R6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC33Q8N5R6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC33Q8N5R6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC33Q8N5R6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC33Q8N5R6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC33Q8N5R6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC33Q8N5R6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC33Q8N5R6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC33Q8N5R6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC33Q8N5R6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC33Q8N5R6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC33Q8N5R6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC33Q8N5R6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC33Q8N5R6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC33Q8N5R6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC33Q8N5R6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC33Q8N5R6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC33Q8N5R6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC33Q8N5R6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC33Q8N5R6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC33Q8N5R6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC33Q8N5R6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC33Q8N5R6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC33Q8N5R6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC33Q8N5R6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC33Q8N5R6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC33Q8N5R6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC33Q8N5R6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC33Q8N5R6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC33Q8N5R6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC33Q8N5R6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC33Q8N5R6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC33Q8N5R6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC33Q8N5R6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC33Q8N5R6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC33Q8N5R6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC33Q8N5R6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC33Q8N5R6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC33Q8N5R6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC33Q8N5R6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC33Q8N5R6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC33Q8N5R6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC33Q8N5R6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC33Q8N5R6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC33Q8N5R6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms