Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CNTROBQ8N137 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CNTROBQ8N137 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CNTROBQ8N137 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CNTROBQ8N137 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CNTROBQ8N137 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CNTROBQ8N137 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CNTROBQ8N137 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CNTROBQ8N137 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CNTROBQ8N137 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CNTROBQ8N137 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CNTROBQ8N137 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CNTROBQ8N137 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CNTROBQ8N137 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CNTROBQ8N137 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CNTROBQ8N137 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CNTROBQ8N137 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CNTROBQ8N137 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CNTROBQ8N137 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CNTROBQ8N137 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CNTROBQ8N137 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CNTROBQ8N137 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CNTROBQ8N137 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CNTROBQ8N137 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CNTROBQ8N137 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CNTROBQ8N137 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CNTROBQ8N137 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CNTROBQ8N137 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CNTROBQ8N137 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CNTROBQ8N137 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CNTROBQ8N137 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CNTROBQ8N137 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CNTROBQ8N137 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CNTROBQ8N137 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CNTROBQ8N137 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CNTROBQ8N137 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CNTROBQ8N137 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CNTROBQ8N137 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CNTROBQ8N137 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CNTROBQ8N137 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CNTROBQ8N137 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CNTROBQ8N137 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CNTROBQ8N137 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CNTROBQ8N137 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CNTROBQ8N137 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CNTROBQ8N137 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CNTROBQ8N137 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CNTROBQ8N137 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CNTROBQ8N137 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CNTROBQ8N137 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CNTROBQ8N137 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CNTROBQ8N137 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CNTROBQ8N137 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CNTROBQ8N137 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CNTROBQ8N137 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CNTROBQ8N137 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CNTROBQ8N137 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CNTROBQ8N137 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CNTROBQ8N137 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CNTROBQ8N137 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CNTROBQ8N137 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CNTROBQ8N137 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CNTROBQ8N137 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CNTROBQ8N137 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CNTROBQ8N137 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CNTROBQ8N137 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CNTROBQ8N137 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CNTROBQ8N137 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CNTROBQ8N137 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CNTROBQ8N137 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CNTROBQ8N137 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CNTROBQ8N137 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CNTROBQ8N137 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CNTROBQ8N137 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CNTROBQ8N137 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CNTROBQ8N137 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CNTROBQ8N137 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CNTROBQ8N137 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CNTROBQ8N137 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CNTROBQ8N137 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CNTROBQ8N137 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CNTROBQ8N137 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CNTROBQ8N137 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CNTROBQ8N137 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CNTROBQ8N137 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CNTROBQ8N137 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CNTROBQ8N137 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CNTROBQ8N137 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CNTROBQ8N137 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CNTROBQ8N137 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CNTROBQ8N137 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CNTROBQ8N137 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CNTROBQ8N137 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CNTROBQ8N137 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CNTROBQ8N137 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CNTROBQ8N137 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CNTROBQ8N137 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CNTROBQ8N137 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CNTROBQ8N137 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CNTROBQ8N137 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms