Protein–RNA interactions for Protein: Q8N114

SHISA5, Protein shisa-5, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA5Q8N114 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHISA5Q8N114 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHISA5Q8N114 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA5Q8N114 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA5Q8N114 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA5Q8N114 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHISA5Q8N114 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHISA5Q8N114 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHISA5Q8N114 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHISA5Q8N114 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHISA5Q8N114 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHISA5Q8N114 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHISA5Q8N114 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SHISA5Q8N114 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHISA5Q8N114 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHISA5Q8N114 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHISA5Q8N114 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHISA5Q8N114 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA5Q8N114 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA5Q8N114 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA5Q8N114 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA5Q8N114 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA5Q8N114 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA5Q8N114 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHISA5Q8N114 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA5Q8N114 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA5Q8N114 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA5Q8N114 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHISA5Q8N114 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHISA5Q8N114 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHISA5Q8N114 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA5Q8N114 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHISA5Q8N114 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA5Q8N114 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA5Q8N114 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA5Q8N114 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA5Q8N114 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHISA5Q8N114 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHISA5Q8N114 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHISA5Q8N114 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA5Q8N114 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA5Q8N114 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA5Q8N114 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHISA5Q8N114 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHISA5Q8N114 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHISA5Q8N114 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHISA5Q8N114 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA5Q8N114 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHISA5Q8N114 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHISA5Q8N114 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHISA5Q8N114 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHISA5Q8N114 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA5Q8N114 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA5Q8N114 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA5Q8N114 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHISA5Q8N114 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHISA5Q8N114 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHISA5Q8N114 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHISA5Q8N114 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA5Q8N114 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA5Q8N114 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA5Q8N114 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA5Q8N114 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SHISA5Q8N114 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHISA5Q8N114 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SHISA5Q8N114 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHISA5Q8N114 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHISA5Q8N114 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SHISA5Q8N114 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHISA5Q8N114 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHISA5Q8N114 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA5Q8N114 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA5Q8N114 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SHISA5Q8N114 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHISA5Q8N114 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHISA5Q8N114 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHISA5Q8N114 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHISA5Q8N114 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHISA5Q8N114 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHISA5Q8N114 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHISA5Q8N114 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHISA5Q8N114 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHISA5Q8N114 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHISA5Q8N114 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHISA5Q8N114 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA5Q8N114 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA5Q8N114 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA5Q8N114 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA5Q8N114 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHISA5Q8N114 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHISA5Q8N114 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA5Q8N114 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA5Q8N114 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA5Q8N114 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA5Q8N114 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA5Q8N114 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA5Q8N114 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHISA5Q8N114 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHISA5Q8N114 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHISA5Q8N114 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms