Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF23Q7RTU1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF23Q7RTU1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF23Q7RTU1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF23Q7RTU1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF23Q7RTU1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF23Q7RTU1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF23Q7RTU1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF23Q7RTU1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF23Q7RTU1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF23Q7RTU1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF23Q7RTU1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF23Q7RTU1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF23Q7RTU1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF23Q7RTU1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF23Q7RTU1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF23Q7RTU1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF23Q7RTU1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF23Q7RTU1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF23Q7RTU1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF23Q7RTU1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF23Q7RTU1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF23Q7RTU1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF23Q7RTU1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF23Q7RTU1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF23Q7RTU1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF23Q7RTU1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF23Q7RTU1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF23Q7RTU1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF23Q7RTU1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF23Q7RTU1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF23Q7RTU1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF23Q7RTU1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF23Q7RTU1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF23Q7RTU1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF23Q7RTU1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF23Q7RTU1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF23Q7RTU1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF23Q7RTU1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF23Q7RTU1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF23Q7RTU1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF23Q7RTU1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF23Q7RTU1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF23Q7RTU1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF23Q7RTU1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF23Q7RTU1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCF23Q7RTU1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF23Q7RTU1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF23Q7RTU1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF23Q7RTU1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF23Q7RTU1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF23Q7RTU1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF23Q7RTU1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF23Q7RTU1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF23Q7RTU1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF23Q7RTU1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF23Q7RTU1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF23Q7RTU1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF23Q7RTU1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF23Q7RTU1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF23Q7RTU1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
TCF23Q7RTU1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF23Q7RTU1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF23Q7RTU1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF23Q7RTU1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF23Q7RTU1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF23Q7RTU1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF23Q7RTU1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF23Q7RTU1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF23Q7RTU1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF23Q7RTU1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF23Q7RTU1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF23Q7RTU1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF23Q7RTU1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF23Q7RTU1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF23Q7RTU1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF23Q7RTU1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF23Q7RTU1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF23Q7RTU1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF23Q7RTU1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF23Q7RTU1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF23Q7RTU1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF23Q7RTU1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF23Q7RTU1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF23Q7RTU1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF23Q7RTU1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF23Q7RTU1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF23Q7RTU1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF23Q7RTU1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF23Q7RTU1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF23Q7RTU1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF23Q7RTU1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF23Q7RTU1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF23Q7RTU1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF23Q7RTU1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF23Q7RTU1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF23Q7RTU1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF23Q7RTU1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF23Q7RTU1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF23Q7RTU1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms