Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP34Q70CQ2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP34Q70CQ2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP34Q70CQ2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP34Q70CQ2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP34Q70CQ2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP34Q70CQ2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP34Q70CQ2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP34Q70CQ2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP34Q70CQ2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP34Q70CQ2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP34Q70CQ2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP34Q70CQ2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP34Q70CQ2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP34Q70CQ2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP34Q70CQ2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP34Q70CQ2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP34Q70CQ2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP34Q70CQ2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP34Q70CQ2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP34Q70CQ2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP34Q70CQ2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP34Q70CQ2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP34Q70CQ2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP34Q70CQ2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP34Q70CQ2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USP34Q70CQ2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP34Q70CQ2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP34Q70CQ2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP34Q70CQ2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP34Q70CQ2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP34Q70CQ2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP34Q70CQ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP34Q70CQ2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP34Q70CQ2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
USP34Q70CQ2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP34Q70CQ2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP34Q70CQ2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP34Q70CQ2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP34Q70CQ2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP34Q70CQ2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP34Q70CQ2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP34Q70CQ2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
USP34Q70CQ2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP34Q70CQ2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP34Q70CQ2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
USP34Q70CQ2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP34Q70CQ2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP34Q70CQ2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP34Q70CQ2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP34Q70CQ2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP34Q70CQ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP34Q70CQ2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP34Q70CQ2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP34Q70CQ2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP34Q70CQ2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP34Q70CQ2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP34Q70CQ2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP34Q70CQ2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP34Q70CQ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP34Q70CQ2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP34Q70CQ2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP34Q70CQ2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP34Q70CQ2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP34Q70CQ2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP34Q70CQ2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
USP34Q70CQ2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP34Q70CQ2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP34Q70CQ2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP34Q70CQ2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP34Q70CQ2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP34Q70CQ2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP34Q70CQ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP34Q70CQ2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP34Q70CQ2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP34Q70CQ2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms