Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
UBR3Q6ZT12 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
UBR3Q6ZT12 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.31■■■■□ 3.24
UBR3Q6ZT12 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
UBR3Q6ZT12 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
UBR3Q6ZT12 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
UBR3Q6ZT12 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
UBR3Q6ZT12 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
UBR3Q6ZT12 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
UBR3Q6ZT12 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
UBR3Q6ZT12 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
UBR3Q6ZT12 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
UBR3Q6ZT12 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
UBR3Q6ZT12 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
UBR3Q6ZT12 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
UBR3Q6ZT12 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
UBR3Q6ZT12 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
UBR3Q6ZT12 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
UBR3Q6ZT12 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
UBR3Q6ZT12 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
UBR3Q6ZT12 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
UBR3Q6ZT12 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
UBR3Q6ZT12 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
UBR3Q6ZT12 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
UBR3Q6ZT12 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
UBR3Q6ZT12 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
UBR3Q6ZT12 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
UBR3Q6ZT12 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
UBR3Q6ZT12 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
UBR3Q6ZT12 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
UBR3Q6ZT12 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
UBR3Q6ZT12 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
UBR3Q6ZT12 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
UBR3Q6ZT12 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
UBR3Q6ZT12 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
UBR3Q6ZT12 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
UBR3Q6ZT12 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
UBR3Q6ZT12 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
UBR3Q6ZT12 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
UBR3Q6ZT12 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
UBR3Q6ZT12 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
UBR3Q6ZT12 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
UBR3Q6ZT12 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
UBR3Q6ZT12 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
UBR3Q6ZT12 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
UBR3Q6ZT12 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
UBR3Q6ZT12 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
UBR3Q6ZT12 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
UBR3Q6ZT12 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
UBR3Q6ZT12 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
UBR3Q6ZT12 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
UBR3Q6ZT12 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
UBR3Q6ZT12 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
UBR3Q6ZT12 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
UBR3Q6ZT12 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
UBR3Q6ZT12 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
UBR3Q6ZT12 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
UBR3Q6ZT12 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
UBR3Q6ZT12 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
UBR3Q6ZT12 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.85■■■■□ 3.17
UBR3Q6ZT12 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
UBR3Q6ZT12 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
UBR3Q6ZT12 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
UBR3Q6ZT12 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
UBR3Q6ZT12 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
UBR3Q6ZT12 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
UBR3Q6ZT12 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
UBR3Q6ZT12 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
UBR3Q6ZT12 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
UBR3Q6ZT12 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
UBR3Q6ZT12 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
UBR3Q6ZT12 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
UBR3Q6ZT12 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
UBR3Q6ZT12 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
UBR3Q6ZT12 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
UBR3Q6ZT12 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
UBR3Q6ZT12 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
UBR3Q6ZT12 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
UBR3Q6ZT12 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
UBR3Q6ZT12 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
UBR3Q6ZT12 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
UBR3Q6ZT12 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
UBR3Q6ZT12 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
UBR3Q6ZT12 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
UBR3Q6ZT12 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
UBR3Q6ZT12 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
UBR3Q6ZT12 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
UBR3Q6ZT12 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
UBR3Q6ZT12 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
UBR3Q6ZT12 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
UBR3Q6ZT12 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
UBR3Q6ZT12 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
UBR3Q6ZT12 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
UBR3Q6ZT12 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
UBR3Q6ZT12 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
UBR3Q6ZT12 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
UBR3Q6ZT12 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
UBR3Q6ZT12 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
UBR3Q6ZT12 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
UBR3Q6ZT12 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms