Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM136Q6ZRR5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM136Q6ZRR5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM136Q6ZRR5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM136Q6ZRR5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM136Q6ZRR5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM136Q6ZRR5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM136Q6ZRR5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM136Q6ZRR5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM136Q6ZRR5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM136Q6ZRR5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM136Q6ZRR5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM136Q6ZRR5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM136Q6ZRR5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM136Q6ZRR5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM136Q6ZRR5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM136Q6ZRR5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM136Q6ZRR5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM136Q6ZRR5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM136Q6ZRR5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM136Q6ZRR5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM136Q6ZRR5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM136Q6ZRR5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM136Q6ZRR5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM136Q6ZRR5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM136Q6ZRR5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM136Q6ZRR5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM136Q6ZRR5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM136Q6ZRR5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM136Q6ZRR5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM136Q6ZRR5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM136Q6ZRR5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM136Q6ZRR5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM136Q6ZRR5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM136Q6ZRR5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM136Q6ZRR5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM136Q6ZRR5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM136Q6ZRR5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM136Q6ZRR5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM136Q6ZRR5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM136Q6ZRR5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM136Q6ZRR5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM136Q6ZRR5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM136Q6ZRR5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM136Q6ZRR5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM136Q6ZRR5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM136Q6ZRR5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM136Q6ZRR5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM136Q6ZRR5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM136Q6ZRR5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM136Q6ZRR5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM136Q6ZRR5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM136Q6ZRR5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM136Q6ZRR5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM136Q6ZRR5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM136Q6ZRR5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM136Q6ZRR5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM136Q6ZRR5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM136Q6ZRR5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM136Q6ZRR5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM136Q6ZRR5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM136Q6ZRR5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM136Q6ZRR5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM136Q6ZRR5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM136Q6ZRR5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM136Q6ZRR5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM136Q6ZRR5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM136Q6ZRR5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM136Q6ZRR5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM136Q6ZRR5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM136Q6ZRR5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM136Q6ZRR5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM136Q6ZRR5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM136Q6ZRR5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM136Q6ZRR5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM136Q6ZRR5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM136Q6ZRR5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM136Q6ZRR5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM136Q6ZRR5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM136Q6ZRR5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM136Q6ZRR5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms