Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMB0

B3GNT6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT6Q6ZMB0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
B3GNT6Q6ZMB0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
B3GNT6Q6ZMB0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
B3GNT6Q6ZMB0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
B3GNT6Q6ZMB0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
B3GNT6Q6ZMB0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
B3GNT6Q6ZMB0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
B3GNT6Q6ZMB0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
B3GNT6Q6ZMB0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
B3GNT6Q6ZMB0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
B3GNT6Q6ZMB0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
B3GNT6Q6ZMB0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
B3GNT6Q6ZMB0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
B3GNT6Q6ZMB0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
B3GNT6Q6ZMB0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
B3GNT6Q6ZMB0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
B3GNT6Q6ZMB0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
B3GNT6Q6ZMB0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
B3GNT6Q6ZMB0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
B3GNT6Q6ZMB0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
B3GNT6Q6ZMB0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
B3GNT6Q6ZMB0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
B3GNT6Q6ZMB0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
B3GNT6Q6ZMB0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
B3GNT6Q6ZMB0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
B3GNT6Q6ZMB0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
B3GNT6Q6ZMB0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
B3GNT6Q6ZMB0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
B3GNT6Q6ZMB0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
B3GNT6Q6ZMB0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
B3GNT6Q6ZMB0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
B3GNT6Q6ZMB0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B3GNT6Q6ZMB0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
B3GNT6Q6ZMB0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
B3GNT6Q6ZMB0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
B3GNT6Q6ZMB0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
B3GNT6Q6ZMB0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
B3GNT6Q6ZMB0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B3GNT6Q6ZMB0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
B3GNT6Q6ZMB0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B3GNT6Q6ZMB0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B3GNT6Q6ZMB0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B3GNT6Q6ZMB0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B3GNT6Q6ZMB0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B3GNT6Q6ZMB0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B3GNT6Q6ZMB0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
B3GNT6Q6ZMB0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B3GNT6Q6ZMB0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
B3GNT6Q6ZMB0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B3GNT6Q6ZMB0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
B3GNT6Q6ZMB0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
B3GNT6Q6ZMB0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
B3GNT6Q6ZMB0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B3GNT6Q6ZMB0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
B3GNT6Q6ZMB0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
B3GNT6Q6ZMB0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
B3GNT6Q6ZMB0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
B3GNT6Q6ZMB0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B3GNT6Q6ZMB0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B3GNT6Q6ZMB0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B3GNT6Q6ZMB0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B3GNT6Q6ZMB0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B3GNT6Q6ZMB0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B3GNT6Q6ZMB0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B3GNT6Q6ZMB0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B3GNT6Q6ZMB0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B3GNT6Q6ZMB0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B3GNT6Q6ZMB0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B3GNT6Q6ZMB0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
B3GNT6Q6ZMB0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B3GNT6Q6ZMB0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B3GNT6Q6ZMB0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B3GNT6Q6ZMB0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B3GNT6Q6ZMB0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B3GNT6Q6ZMB0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B3GNT6Q6ZMB0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B3GNT6Q6ZMB0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
B3GNT6Q6ZMB0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
B3GNT6Q6ZMB0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B3GNT6Q6ZMB0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B3GNT6Q6ZMB0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms