Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHLRC1Q6VVB1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHLRC1Q6VVB1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHLRC1Q6VVB1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHLRC1Q6VVB1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHLRC1Q6VVB1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHLRC1Q6VVB1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHLRC1Q6VVB1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHLRC1Q6VVB1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHLRC1Q6VVB1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NHLRC1Q6VVB1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHLRC1Q6VVB1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHLRC1Q6VVB1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHLRC1Q6VVB1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHLRC1Q6VVB1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHLRC1Q6VVB1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHLRC1Q6VVB1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHLRC1Q6VVB1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHLRC1Q6VVB1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHLRC1Q6VVB1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHLRC1Q6VVB1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHLRC1Q6VVB1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHLRC1Q6VVB1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHLRC1Q6VVB1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHLRC1Q6VVB1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NHLRC1Q6VVB1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHLRC1Q6VVB1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHLRC1Q6VVB1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHLRC1Q6VVB1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHLRC1Q6VVB1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHLRC1Q6VVB1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHLRC1Q6VVB1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHLRC1Q6VVB1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NHLRC1Q6VVB1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHLRC1Q6VVB1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NHLRC1Q6VVB1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHLRC1Q6VVB1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHLRC1Q6VVB1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NHLRC1Q6VVB1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHLRC1Q6VVB1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHLRC1Q6VVB1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHLRC1Q6VVB1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHLRC1Q6VVB1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHLRC1Q6VVB1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHLRC1Q6VVB1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHLRC1Q6VVB1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHLRC1Q6VVB1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHLRC1Q6VVB1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHLRC1Q6VVB1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHLRC1Q6VVB1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHLRC1Q6VVB1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHLRC1Q6VVB1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHLRC1Q6VVB1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NHLRC1Q6VVB1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHLRC1Q6VVB1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHLRC1Q6VVB1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHLRC1Q6VVB1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHLRC1Q6VVB1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHLRC1Q6VVB1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms