Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ALKAL1Q6UXT8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALKAL1Q6UXT8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALKAL1Q6UXT8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALKAL1Q6UXT8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALKAL1Q6UXT8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALKAL1Q6UXT8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ALKAL1Q6UXT8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ALKAL1Q6UXT8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ALKAL1Q6UXT8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ALKAL1Q6UXT8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ALKAL1Q6UXT8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ALKAL1Q6UXT8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ALKAL1Q6UXT8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ALKAL1Q6UXT8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALKAL1Q6UXT8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALKAL1Q6UXT8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ALKAL1Q6UXT8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALKAL1Q6UXT8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALKAL1Q6UXT8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALKAL1Q6UXT8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ALKAL1Q6UXT8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALKAL1Q6UXT8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALKAL1Q6UXT8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ALKAL1Q6UXT8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALKAL1Q6UXT8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKAL1Q6UXT8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKAL1Q6UXT8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALKAL1Q6UXT8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALKAL1Q6UXT8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALKAL1Q6UXT8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALKAL1Q6UXT8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ALKAL1Q6UXT8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALKAL1Q6UXT8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALKAL1Q6UXT8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALKAL1Q6UXT8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ALKAL1Q6UXT8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALKAL1Q6UXT8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALKAL1Q6UXT8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALKAL1Q6UXT8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ALKAL1Q6UXT8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALKAL1Q6UXT8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ALKAL1Q6UXT8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALKAL1Q6UXT8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALKAL1Q6UXT8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALKAL1Q6UXT8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALKAL1Q6UXT8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKAL1Q6UXT8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKAL1Q6UXT8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ALKAL1Q6UXT8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
ALKAL1Q6UXT8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ALKAL1Q6UXT8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ALKAL1Q6UXT8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ALKAL1Q6UXT8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALKAL1Q6UXT8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALKAL1Q6UXT8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALKAL1Q6UXT8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALKAL1Q6UXT8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALKAL1Q6UXT8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKAL1Q6UXT8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKAL1Q6UXT8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKAL1Q6UXT8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKAL1Q6UXT8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALKAL1Q6UXT8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALKAL1Q6UXT8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALKAL1Q6UXT8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALKAL1Q6UXT8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALKAL1Q6UXT8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALKAL1Q6UXT8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKAL1Q6UXT8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKAL1Q6UXT8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKAL1Q6UXT8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALKAL1Q6UXT8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALKAL1Q6UXT8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALKAL1Q6UXT8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALKAL1Q6UXT8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALKAL1Q6UXT8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALKAL1Q6UXT8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKAL1Q6UXT8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKAL1Q6UXT8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKAL1Q6UXT8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALKAL1Q6UXT8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALKAL1Q6UXT8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALKAL1Q6UXT8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALKAL1Q6UXT8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ALKAL1Q6UXT8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ALKAL1Q6UXT8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALKAL1Q6UXT8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALKAL1Q6UXT8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALKAL1Q6UXT8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALKAL1Q6UXT8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKAL1Q6UXT8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKAL1Q6UXT8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKAL1Q6UXT8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKAL1Q6UXT8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALKAL1Q6UXT8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALKAL1Q6UXT8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALKAL1Q6UXT8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALKAL1Q6UXT8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALKAL1Q6UXT8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms