Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKN3Q6P5Z2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PKN3Q6P5Z2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKN3Q6P5Z2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKN3Q6P5Z2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PKN3Q6P5Z2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKN3Q6P5Z2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKN3Q6P5Z2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKN3Q6P5Z2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKN3Q6P5Z2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKN3Q6P5Z2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKN3Q6P5Z2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PKN3Q6P5Z2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PKN3Q6P5Z2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PKN3Q6P5Z2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PKN3Q6P5Z2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKN3Q6P5Z2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKN3Q6P5Z2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKN3Q6P5Z2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PKN3Q6P5Z2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKN3Q6P5Z2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PKN3Q6P5Z2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKN3Q6P5Z2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKN3Q6P5Z2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKN3Q6P5Z2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKN3Q6P5Z2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKN3Q6P5Z2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKN3Q6P5Z2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKN3Q6P5Z2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKN3Q6P5Z2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKN3Q6P5Z2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKN3Q6P5Z2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKN3Q6P5Z2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKN3Q6P5Z2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKN3Q6P5Z2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKN3Q6P5Z2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKN3Q6P5Z2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKN3Q6P5Z2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKN3Q6P5Z2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PKN3Q6P5Z2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKN3Q6P5Z2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKN3Q6P5Z2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKN3Q6P5Z2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKN3Q6P5Z2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PKN3Q6P5Z2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKN3Q6P5Z2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKN3Q6P5Z2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKN3Q6P5Z2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKN3Q6P5Z2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKN3Q6P5Z2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PKN3Q6P5Z2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKN3Q6P5Z2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKN3Q6P5Z2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKN3Q6P5Z2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKN3Q6P5Z2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKN3Q6P5Z2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKN3Q6P5Z2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKN3Q6P5Z2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKN3Q6P5Z2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKN3Q6P5Z2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKN3Q6P5Z2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKN3Q6P5Z2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKN3Q6P5Z2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKN3Q6P5Z2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKN3Q6P5Z2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKN3Q6P5Z2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKN3Q6P5Z2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKN3Q6P5Z2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKN3Q6P5Z2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKN3Q6P5Z2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKN3Q6P5Z2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKN3Q6P5Z2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKN3Q6P5Z2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKN3Q6P5Z2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PKN3Q6P5Z2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKN3Q6P5Z2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PKN3Q6P5Z2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKN3Q6P5Z2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKN3Q6P5Z2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKN3Q6P5Z2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKN3Q6P5Z2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKN3Q6P5Z2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKN3Q6P5Z2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKN3Q6P5Z2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms