Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHLDB3Q6NSJ2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHLDB3Q6NSJ2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHLDB3Q6NSJ2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHLDB3Q6NSJ2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHLDB3Q6NSJ2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHLDB3Q6NSJ2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHLDB3Q6NSJ2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHLDB3Q6NSJ2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHLDB3Q6NSJ2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHLDB3Q6NSJ2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHLDB3Q6NSJ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHLDB3Q6NSJ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHLDB3Q6NSJ2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHLDB3Q6NSJ2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHLDB3Q6NSJ2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHLDB3Q6NSJ2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHLDB3Q6NSJ2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHLDB3Q6NSJ2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHLDB3Q6NSJ2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHLDB3Q6NSJ2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PHLDB3Q6NSJ2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PHLDB3Q6NSJ2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHLDB3Q6NSJ2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHLDB3Q6NSJ2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHLDB3Q6NSJ2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHLDB3Q6NSJ2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHLDB3Q6NSJ2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHLDB3Q6NSJ2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHLDB3Q6NSJ2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHLDB3Q6NSJ2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PHLDB3Q6NSJ2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PHLDB3Q6NSJ2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHLDB3Q6NSJ2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHLDB3Q6NSJ2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHLDB3Q6NSJ2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHLDB3Q6NSJ2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHLDB3Q6NSJ2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHLDB3Q6NSJ2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHLDB3Q6NSJ2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHLDB3Q6NSJ2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHLDB3Q6NSJ2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHLDB3Q6NSJ2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHLDB3Q6NSJ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PHLDB3Q6NSJ2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHLDB3Q6NSJ2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHLDB3Q6NSJ2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHLDB3Q6NSJ2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHLDB3Q6NSJ2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHLDB3Q6NSJ2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHLDB3Q6NSJ2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHLDB3Q6NSJ2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHLDB3Q6NSJ2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PHLDB3Q6NSJ2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PHLDB3Q6NSJ2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHLDB3Q6NSJ2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHLDB3Q6NSJ2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PHLDB3Q6NSJ2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHLDB3Q6NSJ2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHLDB3Q6NSJ2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHLDB3Q6NSJ2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHLDB3Q6NSJ2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHLDB3Q6NSJ2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHLDB3Q6NSJ2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHLDB3Q6NSJ2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PHLDB3Q6NSJ2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHLDB3Q6NSJ2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHLDB3Q6NSJ2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHLDB3Q6NSJ2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHLDB3Q6NSJ2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHLDB3Q6NSJ2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHLDB3Q6NSJ2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHLDB3Q6NSJ2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHLDB3Q6NSJ2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHLDB3Q6NSJ2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PHLDB3Q6NSJ2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHLDB3Q6NSJ2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHLDB3Q6NSJ2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHLDB3Q6NSJ2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHLDB3Q6NSJ2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHLDB3Q6NSJ2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHLDB3Q6NSJ2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHLDB3Q6NSJ2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHLDB3Q6NSJ2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PHLDB3Q6NSJ2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHLDB3Q6NSJ2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHLDB3Q6NSJ2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHLDB3Q6NSJ2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PHLDB3Q6NSJ2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHLDB3Q6NSJ2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHLDB3Q6NSJ2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHLDB3Q6NSJ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PHLDB3Q6NSJ2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHLDB3Q6NSJ2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHLDB3Q6NSJ2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHLDB3Q6NSJ2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHLDB3Q6NSJ2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHLDB3Q6NSJ2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHLDB3Q6NSJ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHLDB3Q6NSJ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms