Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIGD3Q6B0B8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TIGD3Q6B0B8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIGD3Q6B0B8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIGD3Q6B0B8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIGD3Q6B0B8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIGD3Q6B0B8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIGD3Q6B0B8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TIGD3Q6B0B8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TIGD3Q6B0B8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIGD3Q6B0B8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIGD3Q6B0B8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIGD3Q6B0B8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIGD3Q6B0B8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIGD3Q6B0B8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIGD3Q6B0B8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIGD3Q6B0B8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIGD3Q6B0B8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIGD3Q6B0B8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIGD3Q6B0B8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIGD3Q6B0B8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIGD3Q6B0B8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIGD3Q6B0B8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIGD3Q6B0B8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIGD3Q6B0B8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIGD3Q6B0B8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIGD3Q6B0B8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIGD3Q6B0B8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIGD3Q6B0B8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIGD3Q6B0B8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIGD3Q6B0B8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIGD3Q6B0B8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIGD3Q6B0B8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIGD3Q6B0B8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIGD3Q6B0B8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TIGD3Q6B0B8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TIGD3Q6B0B8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIGD3Q6B0B8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIGD3Q6B0B8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIGD3Q6B0B8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIGD3Q6B0B8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIGD3Q6B0B8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIGD3Q6B0B8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIGD3Q6B0B8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIGD3Q6B0B8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIGD3Q6B0B8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIGD3Q6B0B8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIGD3Q6B0B8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIGD3Q6B0B8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIGD3Q6B0B8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIGD3Q6B0B8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIGD3Q6B0B8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIGD3Q6B0B8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIGD3Q6B0B8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TIGD3Q6B0B8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIGD3Q6B0B8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIGD3Q6B0B8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIGD3Q6B0B8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIGD3Q6B0B8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIGD3Q6B0B8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIGD3Q6B0B8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIGD3Q6B0B8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIGD3Q6B0B8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIGD3Q6B0B8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIGD3Q6B0B8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIGD3Q6B0B8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TIGD3Q6B0B8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIGD3Q6B0B8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIGD3Q6B0B8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIGD3Q6B0B8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIGD3Q6B0B8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIGD3Q6B0B8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIGD3Q6B0B8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIGD3Q6B0B8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TIGD3Q6B0B8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TIGD3Q6B0B8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TIGD3Q6B0B8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD3Q6B0B8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD3Q6B0B8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD3Q6B0B8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIGD3Q6B0B8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIGD3Q6B0B8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIGD3Q6B0B8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TIGD3Q6B0B8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD3Q6B0B8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD3Q6B0B8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD3Q6B0B8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD3Q6B0B8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD3Q6B0B8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TIGD3Q6B0B8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIGD3Q6B0B8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIGD3Q6B0B8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIGD3Q6B0B8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIGD3Q6B0B8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIGD3Q6B0B8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIGD3Q6B0B8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIGD3Q6B0B8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIGD3Q6B0B8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIGD3Q6B0B8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIGD3Q6B0B8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.5 ms