Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
C12orf60Q5U649 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
C12orf60Q5U649 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
C12orf60Q5U649 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
C12orf60Q5U649 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
C12orf60Q5U649 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
C12orf60Q5U649 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
C12orf60Q5U649 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
C12orf60Q5U649 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
C12orf60Q5U649 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
C12orf60Q5U649 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
C12orf60Q5U649 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
C12orf60Q5U649 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
C12orf60Q5U649 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
C12orf60Q5U649 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
C12orf60Q5U649 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
C12orf60Q5U649 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
C12orf60Q5U649 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
C12orf60Q5U649 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
C12orf60Q5U649 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
C12orf60Q5U649 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
C12orf60Q5U649 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
C12orf60Q5U649 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
C12orf60Q5U649 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
C12orf60Q5U649 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
C12orf60Q5U649 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
C12orf60Q5U649 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
C12orf60Q5U649 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
C12orf60Q5U649 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
C12orf60Q5U649 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
C12orf60Q5U649 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
C12orf60Q5U649 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
C12orf60Q5U649 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
C12orf60Q5U649 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
C12orf60Q5U649 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
C12orf60Q5U649 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
C12orf60Q5U649 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
C12orf60Q5U649 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
C12orf60Q5U649 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
C12orf60Q5U649 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
C12orf60Q5U649 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
C12orf60Q5U649 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
C12orf60Q5U649 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
C12orf60Q5U649 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
C12orf60Q5U649 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
C12orf60Q5U649 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
C12orf60Q5U649 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
C12orf60Q5U649 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
C12orf60Q5U649 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
C12orf60Q5U649 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
C12orf60Q5U649 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
C12orf60Q5U649 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
C12orf60Q5U649 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
C12orf60Q5U649 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
C12orf60Q5U649 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
C12orf60Q5U649 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
C12orf60Q5U649 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
C12orf60Q5U649 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
C12orf60Q5U649 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
C12orf60Q5U649 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
C12orf60Q5U649 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
C12orf60Q5U649 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
C12orf60Q5U649 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
C12orf60Q5U649 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
C12orf60Q5U649 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
C12orf60Q5U649 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
C12orf60Q5U649 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
C12orf60Q5U649 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
C12orf60Q5U649 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
C12orf60Q5U649 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
C12orf60Q5U649 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
C12orf60Q5U649 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
C12orf60Q5U649 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
C12orf60Q5U649 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
C12orf60Q5U649 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
C12orf60Q5U649 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
C12orf60Q5U649 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
C12orf60Q5U649 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
C12orf60Q5U649 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
C12orf60Q5U649 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
C12orf60Q5U649 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
C12orf60Q5U649 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
C12orf60Q5U649 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
C12orf60Q5U649 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
C12orf60Q5U649 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
C12orf60Q5U649 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
C12orf60Q5U649 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
C12orf60Q5U649 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
C12orf60Q5U649 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
C12orf60Q5U649 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
C12orf60Q5U649 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
C12orf60Q5U649 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
C12orf60Q5U649 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
C12orf60Q5U649 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
C12orf60Q5U649 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
C12orf60Q5U649 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
C12orf60Q5U649 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
C12orf60Q5U649 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
C12orf60Q5U649 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
C12orf60Q5U649 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms