Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
HDGFL1Q5TGJ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HDGFL1Q5TGJ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HDGFL1Q5TGJ6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
HDGFL1Q5TGJ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
HDGFL1Q5TGJ6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
HDGFL1Q5TGJ6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
HDGFL1Q5TGJ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
HDGFL1Q5TGJ6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HDGFL1Q5TGJ6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
HDGFL1Q5TGJ6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
HDGFL1Q5TGJ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
HDGFL1Q5TGJ6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
HDGFL1Q5TGJ6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.95■■■■□ 3.19
HDGFL1Q5TGJ6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
HDGFL1Q5TGJ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
HDGFL1Q5TGJ6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
HDGFL1Q5TGJ6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
HDGFL1Q5TGJ6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
HDGFL1Q5TGJ6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
HDGFL1Q5TGJ6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
HDGFL1Q5TGJ6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
HDGFL1Q5TGJ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
HDGFL1Q5TGJ6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
HDGFL1Q5TGJ6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
HDGFL1Q5TGJ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
HDGFL1Q5TGJ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
HDGFL1Q5TGJ6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
HDGFL1Q5TGJ6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
HDGFL1Q5TGJ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
HDGFL1Q5TGJ6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
HDGFL1Q5TGJ6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
HDGFL1Q5TGJ6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
HDGFL1Q5TGJ6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
HDGFL1Q5TGJ6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
HDGFL1Q5TGJ6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
HDGFL1Q5TGJ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
HDGFL1Q5TGJ6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
HDGFL1Q5TGJ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
HDGFL1Q5TGJ6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
HDGFL1Q5TGJ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
HDGFL1Q5TGJ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
HDGFL1Q5TGJ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
HDGFL1Q5TGJ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
HDGFL1Q5TGJ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HDGFL1Q5TGJ6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
HDGFL1Q5TGJ6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
HDGFL1Q5TGJ6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HDGFL1Q5TGJ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
HDGFL1Q5TGJ6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
HDGFL1Q5TGJ6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
HDGFL1Q5TGJ6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
HDGFL1Q5TGJ6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
HDGFL1Q5TGJ6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HDGFL1Q5TGJ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
HDGFL1Q5TGJ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
HDGFL1Q5TGJ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
HDGFL1Q5TGJ6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
HDGFL1Q5TGJ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
HDGFL1Q5TGJ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HDGFL1Q5TGJ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HDGFL1Q5TGJ6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HDGFL1Q5TGJ6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
HDGFL1Q5TGJ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
HDGFL1Q5TGJ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
HDGFL1Q5TGJ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
HDGFL1Q5TGJ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
HDGFL1Q5TGJ6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
HDGFL1Q5TGJ6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
HDGFL1Q5TGJ6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
HDGFL1Q5TGJ6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
HDGFL1Q5TGJ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
HDGFL1Q5TGJ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
HDGFL1Q5TGJ6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HDGFL1Q5TGJ6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
HDGFL1Q5TGJ6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
HDGFL1Q5TGJ6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HDGFL1Q5TGJ6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HDGFL1Q5TGJ6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HDGFL1Q5TGJ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
HDGFL1Q5TGJ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
HDGFL1Q5TGJ6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
HDGFL1Q5TGJ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
HDGFL1Q5TGJ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HDGFL1Q5TGJ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
HDGFL1Q5TGJ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
HDGFL1Q5TGJ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HDGFL1Q5TGJ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HDGFL1Q5TGJ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HDGFL1Q5TGJ6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HDGFL1Q5TGJ6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HDGFL1Q5TGJ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HDGFL1Q5TGJ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HDGFL1Q5TGJ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HDGFL1Q5TGJ6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HDGFL1Q5TGJ6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
HDGFL1Q5TGJ6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
HDGFL1Q5TGJ6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms