Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SOGA3Q5TF21 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SOGA3Q5TF21 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SOGA3Q5TF21 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SOGA3Q5TF21 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SOGA3Q5TF21 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SOGA3Q5TF21 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SOGA3Q5TF21 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SOGA3Q5TF21 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SOGA3Q5TF21 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SOGA3Q5TF21 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SOGA3Q5TF21 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SOGA3Q5TF21 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SOGA3Q5TF21 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SOGA3Q5TF21 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SOGA3Q5TF21 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SOGA3Q5TF21 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
SOGA3Q5TF21 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SOGA3Q5TF21 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SOGA3Q5TF21 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SOGA3Q5TF21 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SOGA3Q5TF21 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SOGA3Q5TF21 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SOGA3Q5TF21 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SOGA3Q5TF21 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SOGA3Q5TF21 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SOGA3Q5TF21 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SOGA3Q5TF21 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SOGA3Q5TF21 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SOGA3Q5TF21 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SOGA3Q5TF21 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SOGA3Q5TF21 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SOGA3Q5TF21 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SOGA3Q5TF21 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SOGA3Q5TF21 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SOGA3Q5TF21 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SOGA3Q5TF21 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SOGA3Q5TF21 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SOGA3Q5TF21 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SOGA3Q5TF21 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SOGA3Q5TF21 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SOGA3Q5TF21 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SOGA3Q5TF21 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SOGA3Q5TF21 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SOGA3Q5TF21 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SOGA3Q5TF21 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SOGA3Q5TF21 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SOGA3Q5TF21 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SOGA3Q5TF21 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SOGA3Q5TF21 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SOGA3Q5TF21 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SOGA3Q5TF21 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SOGA3Q5TF21 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SOGA3Q5TF21 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SOGA3Q5TF21 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SOGA3Q5TF21 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SOGA3Q5TF21 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SOGA3Q5TF21 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SOGA3Q5TF21 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SOGA3Q5TF21 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SOGA3Q5TF21 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SOGA3Q5TF21 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SOGA3Q5TF21 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SOGA3Q5TF21 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SOGA3Q5TF21 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SOGA3Q5TF21 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SOGA3Q5TF21 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SOGA3Q5TF21 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SOGA3Q5TF21 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SOGA3Q5TF21 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SOGA3Q5TF21 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SOGA3Q5TF21 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SOGA3Q5TF21 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SOGA3Q5TF21 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SOGA3Q5TF21 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SOGA3Q5TF21 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SOGA3Q5TF21 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SOGA3Q5TF21 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SOGA3Q5TF21 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SOGA3Q5TF21 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SOGA3Q5TF21 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SOGA3Q5TF21 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SOGA3Q5TF21 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SOGA3Q5TF21 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SOGA3Q5TF21 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SOGA3Q5TF21 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SOGA3Q5TF21 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SOGA3Q5TF21 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
SOGA3Q5TF21 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SOGA3Q5TF21 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SOGA3Q5TF21 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SOGA3Q5TF21 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SOGA3Q5TF21 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SOGA3Q5TF21 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SOGA3Q5TF21 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SOGA3Q5TF21 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SOGA3Q5TF21 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SOGA3Q5TF21 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SOGA3Q5TF21 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SOGA3Q5TF21 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms