Protein–RNA interactions for Protein: Q5T200

ZC3H13, Zinc finger CCCH domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H13Q5T200 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ZC3H13Q5T200 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
ZC3H13Q5T200 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ZC3H13Q5T200 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
ZC3H13Q5T200 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ZC3H13Q5T200 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
ZC3H13Q5T200 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ZC3H13Q5T200 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
ZC3H13Q5T200 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
ZC3H13Q5T200 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ZC3H13Q5T200 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ZC3H13Q5T200 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ZC3H13Q5T200 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ZC3H13Q5T200 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.59■■■■■ 4.09
ZC3H13Q5T200 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
ZC3H13Q5T200 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ZC3H13Q5T200 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.57■■■■■ 4.09
ZC3H13Q5T200 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
ZC3H13Q5T200 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
ZC3H13Q5T200 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
ZC3H13Q5T200 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
ZC3H13Q5T200 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ZC3H13Q5T200 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
ZC3H13Q5T200 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ZC3H13Q5T200 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ZC3H13Q5T200 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ZC3H13Q5T200 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ZC3H13Q5T200 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ZC3H13Q5T200 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ZC3H13Q5T200 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ZC3H13Q5T200 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ZC3H13Q5T200 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ZC3H13Q5T200 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
ZC3H13Q5T200 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
ZC3H13Q5T200 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
ZC3H13Q5T200 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
ZC3H13Q5T200 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
ZC3H13Q5T200 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
ZC3H13Q5T200 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.06
ZC3H13Q5T200 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
ZC3H13Q5T200 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
ZC3H13Q5T200 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
ZC3H13Q5T200 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
ZC3H13Q5T200 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
ZC3H13Q5T200 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
ZC3H13Q5T200 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
ZC3H13Q5T200 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ZC3H13Q5T200 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
ZC3H13Q5T200 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
ZC3H13Q5T200 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
ZC3H13Q5T200 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ZC3H13Q5T200 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
ZC3H13Q5T200 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ZC3H13Q5T200 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ZC3H13Q5T200 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ZC3H13Q5T200 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ZC3H13Q5T200 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
ZC3H13Q5T200 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ZC3H13Q5T200 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ZC3H13Q5T200 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ZC3H13Q5T200 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ZC3H13Q5T200 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ZC3H13Q5T200 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ZC3H13Q5T200 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ZC3H13Q5T200 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ZC3H13Q5T200 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
ZC3H13Q5T200 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ZC3H13Q5T200 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ZC3H13Q5T200 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ZC3H13Q5T200 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
ZC3H13Q5T200 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ZC3H13Q5T200 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
ZC3H13Q5T200 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
ZC3H13Q5T200 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
ZC3H13Q5T200 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.07■■■■■ 4
ZC3H13Q5T200 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
ZC3H13Q5T200 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ZC3H13Q5T200 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
ZC3H13Q5T200 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ZC3H13Q5T200 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ZC3H13Q5T200 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
ZC3H13Q5T200 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
ZC3H13Q5T200 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
ZC3H13Q5T200 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
ZC3H13Q5T200 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
ZC3H13Q5T200 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
ZC3H13Q5T200 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
ZC3H13Q5T200 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
ZC3H13Q5T200 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
ZC3H13Q5T200 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.96■■■■□ 3.99
ZC3H13Q5T200 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
ZC3H13Q5T200 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
ZC3H13Q5T200 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
ZC3H13Q5T200 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
ZC3H13Q5T200 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
ZC3H13Q5T200 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
ZC3H13Q5T200 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
ZC3H13Q5T200 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
ZC3H13Q5T200 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
ZC3H13Q5T200 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms