Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RTL5Q5HYW3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RTL5Q5HYW3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RTL5Q5HYW3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RTL5Q5HYW3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RTL5Q5HYW3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RTL5Q5HYW3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RTL5Q5HYW3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RTL5Q5HYW3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RTL5Q5HYW3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RTL5Q5HYW3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RTL5Q5HYW3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RTL5Q5HYW3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
RTL5Q5HYW3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RTL5Q5HYW3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RTL5Q5HYW3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RTL5Q5HYW3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RTL5Q5HYW3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RTL5Q5HYW3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RTL5Q5HYW3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
RTL5Q5HYW3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RTL5Q5HYW3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
RTL5Q5HYW3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RTL5Q5HYW3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RTL5Q5HYW3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RTL5Q5HYW3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RTL5Q5HYW3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RTL5Q5HYW3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RTL5Q5HYW3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RTL5Q5HYW3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RTL5Q5HYW3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RTL5Q5HYW3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RTL5Q5HYW3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RTL5Q5HYW3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RTL5Q5HYW3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RTL5Q5HYW3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RTL5Q5HYW3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
RTL5Q5HYW3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RTL5Q5HYW3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RTL5Q5HYW3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RTL5Q5HYW3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RTL5Q5HYW3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RTL5Q5HYW3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RTL5Q5HYW3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RTL5Q5HYW3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
RTL5Q5HYW3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RTL5Q5HYW3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RTL5Q5HYW3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RTL5Q5HYW3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RTL5Q5HYW3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RTL5Q5HYW3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RTL5Q5HYW3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RTL5Q5HYW3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RTL5Q5HYW3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RTL5Q5HYW3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RTL5Q5HYW3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RTL5Q5HYW3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RTL5Q5HYW3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RTL5Q5HYW3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RTL5Q5HYW3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RTL5Q5HYW3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RTL5Q5HYW3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RTL5Q5HYW3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
RTL5Q5HYW3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RTL5Q5HYW3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
RTL5Q5HYW3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RTL5Q5HYW3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
RTL5Q5HYW3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RTL5Q5HYW3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RTL5Q5HYW3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RTL5Q5HYW3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RTL5Q5HYW3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
RTL5Q5HYW3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RTL5Q5HYW3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RTL5Q5HYW3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RTL5Q5HYW3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RTL5Q5HYW3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RTL5Q5HYW3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
RTL5Q5HYW3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RTL5Q5HYW3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RTL5Q5HYW3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RTL5Q5HYW3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms