Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HERC4Q5GLZ8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HERC4Q5GLZ8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HERC4Q5GLZ8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HERC4Q5GLZ8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HERC4Q5GLZ8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HERC4Q5GLZ8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HERC4Q5GLZ8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HERC4Q5GLZ8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HERC4Q5GLZ8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HERC4Q5GLZ8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HERC4Q5GLZ8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
HERC4Q5GLZ8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HERC4Q5GLZ8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HERC4Q5GLZ8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HERC4Q5GLZ8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HERC4Q5GLZ8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HERC4Q5GLZ8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HERC4Q5GLZ8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HERC4Q5GLZ8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HERC4Q5GLZ8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
HERC4Q5GLZ8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HERC4Q5GLZ8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HERC4Q5GLZ8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HERC4Q5GLZ8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HERC4Q5GLZ8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HERC4Q5GLZ8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HERC4Q5GLZ8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
HERC4Q5GLZ8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HERC4Q5GLZ8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HERC4Q5GLZ8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HERC4Q5GLZ8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HERC4Q5GLZ8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HERC4Q5GLZ8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HERC4Q5GLZ8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HERC4Q5GLZ8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HERC4Q5GLZ8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HERC4Q5GLZ8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HERC4Q5GLZ8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HERC4Q5GLZ8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HERC4Q5GLZ8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HERC4Q5GLZ8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HERC4Q5GLZ8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HERC4Q5GLZ8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HERC4Q5GLZ8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HERC4Q5GLZ8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HERC4Q5GLZ8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
HERC4Q5GLZ8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HERC4Q5GLZ8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HERC4Q5GLZ8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HERC4Q5GLZ8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HERC4Q5GLZ8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HERC4Q5GLZ8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HERC4Q5GLZ8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HERC4Q5GLZ8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HERC4Q5GLZ8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HERC4Q5GLZ8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
HERC4Q5GLZ8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HERC4Q5GLZ8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HERC4Q5GLZ8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HERC4Q5GLZ8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HERC4Q5GLZ8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HERC4Q5GLZ8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HERC4Q5GLZ8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HERC4Q5GLZ8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HERC4Q5GLZ8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HERC4Q5GLZ8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HERC4Q5GLZ8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
HERC4Q5GLZ8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HERC4Q5GLZ8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HERC4Q5GLZ8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HERC4Q5GLZ8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HERC4Q5GLZ8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HERC4Q5GLZ8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HERC4Q5GLZ8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HERC4Q5GLZ8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HERC4Q5GLZ8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HERC4Q5GLZ8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
HERC4Q5GLZ8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HERC4Q5GLZ8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HERC4Q5GLZ8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
HERC4Q5GLZ8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HERC4Q5GLZ8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HERC4Q5GLZ8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HERC4Q5GLZ8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HERC4Q5GLZ8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
HERC4Q5GLZ8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HERC4Q5GLZ8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HERC4Q5GLZ8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HERC4Q5GLZ8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HERC4Q5GLZ8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HERC4Q5GLZ8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HERC4Q5GLZ8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HERC4Q5GLZ8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HERC4Q5GLZ8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HERC4Q5GLZ8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HERC4Q5GLZ8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HERC4Q5GLZ8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HERC4Q5GLZ8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HERC4Q5GLZ8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms