Protein–RNA interactions for Protein: Q4AC94

C2CD3, C2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD3Q4AC94 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2CD3Q4AC94 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2CD3Q4AC94 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2CD3Q4AC94 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2CD3Q4AC94 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2CD3Q4AC94 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2CD3Q4AC94 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms