Protein–RNA interactions for Protein: Q49A88

CCDC14, Coiled-coil domain-containing protein 14, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC14Q49A88 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC14Q49A88 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC14Q49A88 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC14Q49A88 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC14Q49A88 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC14Q49A88 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC14Q49A88 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC14Q49A88 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC14Q49A88 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC14Q49A88 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC14Q49A88 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC14Q49A88 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC14Q49A88 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC14Q49A88 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC14Q49A88 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC14Q49A88 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC14Q49A88 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC14Q49A88 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC14Q49A88 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC14Q49A88 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC14Q49A88 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC14Q49A88 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC14Q49A88 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC14Q49A88 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC14Q49A88 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC14Q49A88 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC14Q49A88 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC14Q49A88 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC14Q49A88 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC14Q49A88 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC14Q49A88 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC14Q49A88 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC14Q49A88 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC14Q49A88 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC14Q49A88 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC14Q49A88 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC14Q49A88 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC14Q49A88 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC14Q49A88 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC14Q49A88 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC14Q49A88 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC14Q49A88 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC14Q49A88 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC14Q49A88 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC14Q49A88 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC14Q49A88 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC14Q49A88 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC14Q49A88 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC14Q49A88 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC14Q49A88 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC14Q49A88 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC14Q49A88 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC14Q49A88 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC14Q49A88 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC14Q49A88 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC14Q49A88 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC14Q49A88 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC14Q49A88 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC14Q49A88 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC14Q49A88 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC14Q49A88 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC14Q49A88 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC14Q49A88 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC14Q49A88 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC14Q49A88 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC14Q49A88 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC14Q49A88 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC14Q49A88 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC14Q49A88 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC14Q49A88 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC14Q49A88 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC14Q49A88 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC14Q49A88 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC14Q49A88 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC14Q49A88 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC14Q49A88 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC14Q49A88 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC14Q49A88 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC14Q49A88 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC14Q49A88 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC14Q49A88 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC14Q49A88 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC14Q49A88 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC14Q49A88 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC14Q49A88 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC14Q49A88 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC14Q49A88 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC14Q49A88 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC14Q49A88 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC14Q49A88 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC14Q49A88 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC14Q49A88 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC14Q49A88 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC14Q49A88 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC14Q49A88 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC14Q49A88 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC14Q49A88 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC14Q49A88 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC14Q49A88 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC14Q49A88 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms