Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZM63

ETDB, Embryonic testis differentiation homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETDBQ3ZM63 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETDBQ3ZM63 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETDBQ3ZM63 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ETDBQ3ZM63 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETDBQ3ZM63 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETDBQ3ZM63 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETDBQ3ZM63 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETDBQ3ZM63 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETDBQ3ZM63 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETDBQ3ZM63 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETDBQ3ZM63 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETDBQ3ZM63 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETDBQ3ZM63 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETDBQ3ZM63 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ETDBQ3ZM63 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ETDBQ3ZM63 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETDBQ3ZM63 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms