Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBB8Q3ZCM7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBB8Q3ZCM7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBB8Q3ZCM7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBB8Q3ZCM7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBB8Q3ZCM7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBB8Q3ZCM7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBB8Q3ZCM7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBB8Q3ZCM7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBB8Q3ZCM7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBB8Q3ZCM7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBB8Q3ZCM7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBB8Q3ZCM7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBB8Q3ZCM7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBB8Q3ZCM7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBB8Q3ZCM7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBB8Q3ZCM7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBB8Q3ZCM7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TUBB8Q3ZCM7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBB8Q3ZCM7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBB8Q3ZCM7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBB8Q3ZCM7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBB8Q3ZCM7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBB8Q3ZCM7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBB8Q3ZCM7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBB8Q3ZCM7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBB8Q3ZCM7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBB8Q3ZCM7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBB8Q3ZCM7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBB8Q3ZCM7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBB8Q3ZCM7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBB8Q3ZCM7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBB8Q3ZCM7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TUBB8Q3ZCM7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBB8Q3ZCM7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBB8Q3ZCM7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBB8Q3ZCM7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBB8Q3ZCM7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBB8Q3ZCM7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBB8Q3ZCM7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBB8Q3ZCM7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBB8Q3ZCM7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBB8Q3ZCM7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBB8Q3ZCM7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBB8Q3ZCM7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2
TUBB8Q3ZCM7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBB8Q3ZCM7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBB8Q3ZCM7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUBB8Q3ZCM7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB8Q3ZCM7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB8Q3ZCM7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TUBB8Q3ZCM7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TUBB8Q3ZCM7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TUBB8Q3ZCM7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TUBB8Q3ZCM7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBB8Q3ZCM7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBB8Q3ZCM7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBB8Q3ZCM7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBB8Q3ZCM7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBB8Q3ZCM7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBB8Q3ZCM7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBB8Q3ZCM7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBB8Q3ZCM7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBB8Q3ZCM7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBB8Q3ZCM7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBB8Q3ZCM7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBB8Q3ZCM7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBB8Q3ZCM7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBB8Q3ZCM7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBB8Q3ZCM7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBB8Q3ZCM7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TUBB8Q3ZCM7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBB8Q3ZCM7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBB8Q3ZCM7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms