Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
KRTAP21-1Q3LI58 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms