Protein–RNA interactions for Protein: Q16739

UGCG, Ceramide glucosyltransferase, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UGCGQ16739 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UGCGQ16739 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
UGCGQ16739 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UGCGQ16739 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
UGCGQ16739 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
UGCGQ16739 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
UGCGQ16739 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
UGCGQ16739 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
UGCGQ16739 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
UGCGQ16739 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
UGCGQ16739 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UGCGQ16739 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
UGCGQ16739 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
UGCGQ16739 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UGCGQ16739 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
UGCGQ16739 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
UGCGQ16739 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
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UGCGQ16739 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UGCGQ16739 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
UGCGQ16739 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
UGCGQ16739 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
UGCGQ16739 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
UGCGQ16739 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UGCGQ16739 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
UGCGQ16739 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
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UGCGQ16739 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
UGCGQ16739 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UGCGQ16739 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UGCGQ16739 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UGCGQ16739 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
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UGCGQ16739 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
UGCGQ16739 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UGCGQ16739 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
UGCGQ16739 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
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UGCGQ16739 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
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UGCGQ16739 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
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UGCGQ16739 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
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UGCGQ16739 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
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UGCGQ16739 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
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UGCGQ16739 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
UGCGQ16739 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
UGCGQ16739 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
UGCGQ16739 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
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UGCGQ16739 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UGCGQ16739 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UGCGQ16739 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UGCGQ16739 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UGCGQ16739 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UGCGQ16739 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
UGCGQ16739 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
UGCGQ16739 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
UGCGQ16739 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
UGCGQ16739 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UGCGQ16739 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UGCGQ16739 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UGCGQ16739 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UGCGQ16739 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
UGCGQ16739 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UGCGQ16739 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
UGCGQ16739 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UGCGQ16739 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UGCGQ16739 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UGCGQ16739 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UGCGQ16739 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UGCGQ16739 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UGCGQ16739 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
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