Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TBR1Q16650 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBR1Q16650 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBR1Q16650 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBR1Q16650 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TBR1Q16650 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBR1Q16650 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBR1Q16650 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBR1Q16650 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBR1Q16650 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBR1Q16650 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBR1Q16650 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TBR1Q16650 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TBR1Q16650 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TBR1Q16650 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TBR1Q16650 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TBR1Q16650 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TBR1Q16650 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBR1Q16650 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TBR1Q16650 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TBR1Q16650 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TBR1Q16650 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TBR1Q16650 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TBR1Q16650 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TBR1Q16650 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TBR1Q16650 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBR1Q16650 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TBR1Q16650 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBR1Q16650 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBR1Q16650 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBR1Q16650 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBR1Q16650 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBR1Q16650 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBR1Q16650 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TBR1Q16650 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBR1Q16650 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBR1Q16650 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBR1Q16650 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TBR1Q16650 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBR1Q16650 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBR1Q16650 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBR1Q16650 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBR1Q16650 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBR1Q16650 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBR1Q16650 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBR1Q16650 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBR1Q16650 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBR1Q16650 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBR1Q16650 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBR1Q16650 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBR1Q16650 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBR1Q16650 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBR1Q16650 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBR1Q16650 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBR1Q16650 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBR1Q16650 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBR1Q16650 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBR1Q16650 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBR1Q16650 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBR1Q16650 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBR1Q16650 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBR1Q16650 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBR1Q16650 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBR1Q16650 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TBR1Q16650 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TBR1Q16650 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TBR1Q16650 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBR1Q16650 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBR1Q16650 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBR1Q16650 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBR1Q16650 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TBR1Q16650 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBR1Q16650 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TBR1Q16650 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TBR1Q16650 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TBR1Q16650 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TBR1Q16650 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TBR1Q16650 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TBR1Q16650 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TBR1Q16650 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TBR1Q16650 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TBR1Q16650 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TBR1Q16650 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TBR1Q16650 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TBR1Q16650 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TBR1Q16650 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TBR1Q16650 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TBR1Q16650 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TBR1Q16650 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TBR1Q16650 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TBR1Q16650 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TBR1Q16650 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TBR1Q16650 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TBR1Q16650 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBR1Q16650 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBR1Q16650 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBR1Q16650 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBR1Q16650 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBR1Q16650 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBR1Q16650 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
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