Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
DDB1Q16531 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
DDB1Q16531 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DDB1Q16531 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
DDB1Q16531 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DDB1Q16531 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DDB1Q16531 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DDB1Q16531 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
DDB1Q16531 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DDB1Q16531 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
DDB1Q16531 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
DDB1Q16531 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DDB1Q16531 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DDB1Q16531 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
DDB1Q16531 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
DDB1Q16531 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DDB1Q16531 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
DDB1Q16531 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DDB1Q16531 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DDB1Q16531 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
DDB1Q16531 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
DDB1Q16531 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
DDB1Q16531 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
DDB1Q16531 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
DDB1Q16531 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
DDB1Q16531 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
DDB1Q16531 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
DDB1Q16531 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
DDB1Q16531 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
DDB1Q16531 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
DDB1Q16531 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
DDB1Q16531 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
DDB1Q16531 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
DDB1Q16531 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
DDB1Q16531 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
DDB1Q16531 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
DDB1Q16531 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
DDB1Q16531 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
DDB1Q16531 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
DDB1Q16531 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
DDB1Q16531 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DDB1Q16531 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
DDB1Q16531 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
DDB1Q16531 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
DDB1Q16531 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
DDB1Q16531 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
DDB1Q16531 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
DDB1Q16531 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
DDB1Q16531 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
DDB1Q16531 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DDB1Q16531 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DDB1Q16531 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
DDB1Q16531 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
DDB1Q16531 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
DDB1Q16531 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
DDB1Q16531 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DDB1Q16531 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DDB1Q16531 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DDB1Q16531 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
DDB1Q16531 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
DDB1Q16531 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.36
DDB1Q16531 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
DDB1Q16531 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
DDB1Q16531 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DDB1Q16531 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
DDB1Q16531 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
DDB1Q16531 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
DDB1Q16531 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
DDB1Q16531 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DDB1Q16531 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DDB1Q16531 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DDB1Q16531 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
DDB1Q16531 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
DDB1Q16531 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
DDB1Q16531 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DDB1Q16531 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
DDB1Q16531 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
DDB1Q16531 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
DDB1Q16531 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
DDB1Q16531 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
DDB1Q16531 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
DDB1Q16531 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
DDB1Q16531 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
DDB1Q16531 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DDB1Q16531 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
DDB1Q16531 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DDB1Q16531 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DDB1Q16531 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
DDB1Q16531 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
DDB1Q16531 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
DDB1Q16531 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
DDB1Q16531 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
DDB1Q16531 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
DDB1Q16531 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
DDB1Q16531 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
DDB1Q16531 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
DDB1Q16531 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
DDB1Q16531 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
DDB1Q16531 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
DDB1Q16531 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
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