Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
ARHGEF6Q15052 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ARHGEF6Q15052 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ARHGEF6Q15052 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ARHGEF6Q15052 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ARHGEF6Q15052 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ARHGEF6Q15052 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ARHGEF6Q15052 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ARHGEF6Q15052 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ARHGEF6Q15052 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ARHGEF6Q15052 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ARHGEF6Q15052 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ARHGEF6Q15052 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ARHGEF6Q15052 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ARHGEF6Q15052 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ARHGEF6Q15052 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ARHGEF6Q15052 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ARHGEF6Q15052 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARHGEF6Q15052 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARHGEF6Q15052 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARHGEF6Q15052 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARHGEF6Q15052 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARHGEF6Q15052 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARHGEF6Q15052 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARHGEF6Q15052 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARHGEF6Q15052 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
ARHGEF6Q15052 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARHGEF6Q15052 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
ARHGEF6Q15052 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARHGEF6Q15052 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARHGEF6Q15052 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARHGEF6Q15052 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARHGEF6Q15052 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARHGEF6Q15052 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ARHGEF6Q15052 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ARHGEF6Q15052 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARHGEF6Q15052 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
ARHGEF6Q15052 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ARHGEF6Q15052 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ARHGEF6Q15052 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARHGEF6Q15052 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ARHGEF6Q15052 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ARHGEF6Q15052 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ARHGEF6Q15052 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ARHGEF6Q15052 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ARHGEF6Q15052 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ARHGEF6Q15052 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ARHGEF6Q15052 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
ARHGEF6Q15052 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARHGEF6Q15052 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARHGEF6Q15052 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARHGEF6Q15052 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARHGEF6Q15052 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARHGEF6Q15052 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARHGEF6Q15052 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ARHGEF6Q15052 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ARHGEF6Q15052 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ARHGEF6Q15052 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ARHGEF6Q15052 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ARHGEF6Q15052 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ARHGEF6Q15052 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ARHGEF6Q15052 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ARHGEF6Q15052 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ARHGEF6Q15052 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
ARHGEF6Q15052 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ARHGEF6Q15052 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ARHGEF6Q15052 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ARHGEF6Q15052 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ARHGEF6Q15052 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ARHGEF6Q15052 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ARHGEF6Q15052 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ARHGEF6Q15052 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ARHGEF6Q15052 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ARHGEF6Q15052 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ARHGEF6Q15052 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
ARHGEF6Q15052 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ARHGEF6Q15052 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
ARHGEF6Q15052 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ARHGEF6Q15052 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
ARHGEF6Q15052 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARHGEF6Q15052 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
ARHGEF6Q15052 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
ARHGEF6Q15052 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
ARHGEF6Q15052 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARHGEF6Q15052 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ARHGEF6Q15052 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ARHGEF6Q15052 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ARHGEF6Q15052 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ARHGEF6Q15052 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ARHGEF6Q15052 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ARHGEF6Q15052 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ARHGEF6Q15052 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
ARHGEF6Q15052 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ARHGEF6Q15052 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ARHGEF6Q15052 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ARHGEF6Q15052 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ARHGEF6Q15052 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ARHGEF6Q15052 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ARHGEF6Q15052 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ARHGEF6Q15052 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
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