Protein–RNA interactions for Protein: Q14D33

RTP5, Receptor-transporting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP5Q14D33 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP5Q14D33 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP5Q14D33 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP5Q14D33 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP5Q14D33 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP5Q14D33 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP5Q14D33 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP5Q14D33 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP5Q14D33 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP5Q14D33 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP5Q14D33 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP5Q14D33 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP5Q14D33 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP5Q14D33 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP5Q14D33 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP5Q14D33 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTP5Q14D33 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTP5Q14D33 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTP5Q14D33 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RTP5Q14D33 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTP5Q14D33 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTP5Q14D33 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP5Q14D33 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP5Q14D33 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP5Q14D33 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP5Q14D33 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTP5Q14D33 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP5Q14D33 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RTP5Q14D33 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP5Q14D33 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTP5Q14D33 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTP5Q14D33 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTP5Q14D33 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTP5Q14D33 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTP5Q14D33 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTP5Q14D33 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RTP5Q14D33 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTP5Q14D33 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTP5Q14D33 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RTP5Q14D33 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTP5Q14D33 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTP5Q14D33 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTP5Q14D33 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP5Q14D33 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP5Q14D33 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP5Q14D33 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP5Q14D33 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTP5Q14D33 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTP5Q14D33 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTP5Q14D33 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP5Q14D33 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP5Q14D33 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP5Q14D33 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTP5Q14D33 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP5Q14D33 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTP5Q14D33 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTP5Q14D33 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP5Q14D33 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP5Q14D33 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP5Q14D33 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP5Q14D33 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP5Q14D33 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP5Q14D33 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP5Q14D33 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP5Q14D33 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP5Q14D33 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP5Q14D33 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP5Q14D33 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP5Q14D33 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP5Q14D33 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP5Q14D33 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP5Q14D33 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP5Q14D33 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP5Q14D33 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP5Q14D33 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP5Q14D33 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP5Q14D33 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP5Q14D33 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP5Q14D33 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP5Q14D33 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP5Q14D33 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP5Q14D33 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTP5Q14D33 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTP5Q14D33 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP5Q14D33 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP5Q14D33 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP5Q14D33 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP5Q14D33 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP5Q14D33 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP5Q14D33 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP5Q14D33 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP5Q14D33 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP5Q14D33 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP5Q14D33 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP5Q14D33 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP5Q14D33 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP5Q14D33 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP5Q14D33 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP5Q14D33 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP5Q14D33 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms