Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RFTN1Q14699 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RFTN1Q14699 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFTN1Q14699 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFTN1Q14699 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFTN1Q14699 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFTN1Q14699 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RFTN1Q14699 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFTN1Q14699 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFTN1Q14699 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFTN1Q14699 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFTN1Q14699 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFTN1Q14699 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFTN1Q14699 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFTN1Q14699 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFTN1Q14699 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFTN1Q14699 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFTN1Q14699 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFTN1Q14699 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RFTN1Q14699 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFTN1Q14699 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RFTN1Q14699 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFTN1Q14699 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFTN1Q14699 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFTN1Q14699 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFTN1Q14699 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFTN1Q14699 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFTN1Q14699 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFTN1Q14699 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RFTN1Q14699 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFTN1Q14699 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFTN1Q14699 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RFTN1Q14699 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFTN1Q14699 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RFTN1Q14699 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RFTN1Q14699 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFTN1Q14699 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFTN1Q14699 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFTN1Q14699 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RFTN1Q14699 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFTN1Q14699 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFTN1Q14699 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RFTN1Q14699 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFTN1Q14699 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RFTN1Q14699 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFTN1Q14699 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFTN1Q14699 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFTN1Q14699 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFTN1Q14699 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFTN1Q14699 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFTN1Q14699 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFTN1Q14699 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFTN1Q14699 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFTN1Q14699 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFTN1Q14699 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFTN1Q14699 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFTN1Q14699 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFTN1Q14699 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFTN1Q14699 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFTN1Q14699 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFTN1Q14699 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFTN1Q14699 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFTN1Q14699 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFTN1Q14699 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFTN1Q14699 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFTN1Q14699 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFTN1Q14699 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFTN1Q14699 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFTN1Q14699 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFTN1Q14699 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFTN1Q14699 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFTN1Q14699 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFTN1Q14699 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFTN1Q14699 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RFTN1Q14699 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFTN1Q14699 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFTN1Q14699 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFTN1Q14699 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFTN1Q14699 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFTN1Q14699 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFTN1Q14699 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFTN1Q14699 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFTN1Q14699 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFTN1Q14699 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFTN1Q14699 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFTN1Q14699 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFTN1Q14699 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RFTN1Q14699 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFTN1Q14699 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFTN1Q14699 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFTN1Q14699 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RFTN1Q14699 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFTN1Q14699 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFTN1Q14699 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFTN1Q14699 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFTN1Q14699 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFTN1Q14699 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFTN1Q14699 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFTN1Q14699 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFTN1Q14699 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
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