Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIRBPQ14011 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIRBPQ14011 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIRBPQ14011 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CIRBPQ14011 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIRBPQ14011 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIRBPQ14011 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIRBPQ14011 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIRBPQ14011 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIRBPQ14011 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIRBPQ14011 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIRBPQ14011 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIRBPQ14011 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIRBPQ14011 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIRBPQ14011 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIRBPQ14011 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIRBPQ14011 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIRBPQ14011 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIRBPQ14011 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIRBPQ14011 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIRBPQ14011 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CIRBPQ14011 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIRBPQ14011 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CIRBPQ14011 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIRBPQ14011 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIRBPQ14011 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIRBPQ14011 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIRBPQ14011 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIRBPQ14011 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIRBPQ14011 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIRBPQ14011 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIRBPQ14011 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIRBPQ14011 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIRBPQ14011 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIRBPQ14011 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIRBPQ14011 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIRBPQ14011 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIRBPQ14011 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIRBPQ14011 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIRBPQ14011 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIRBPQ14011 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIRBPQ14011 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIRBPQ14011 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIRBPQ14011 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIRBPQ14011 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIRBPQ14011 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIRBPQ14011 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIRBPQ14011 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIRBPQ14011 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIRBPQ14011 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIRBPQ14011 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIRBPQ14011 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CIRBPQ14011 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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