Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
SHROOM2Q13796 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
SHROOM2Q13796 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
SHROOM2Q13796 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
SHROOM2Q13796 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC44.99■■■■■ 4.79
SHROOM2Q13796 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
SHROOM2Q13796 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC44.94■■■■■ 4.79
SHROOM2Q13796 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
SHROOM2Q13796 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
SHROOM2Q13796 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
SHROOM2Q13796 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
SHROOM2Q13796 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
SHROOM2Q13796 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
SHROOM2Q13796 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
SHROOM2Q13796 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
SHROOM2Q13796 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
SHROOM2Q13796 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
SHROOM2Q13796 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
SHROOM2Q13796 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
SHROOM2Q13796 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
SHROOM2Q13796 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
SHROOM2Q13796 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
SHROOM2Q13796 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
SHROOM2Q13796 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.75
SHROOM2Q13796 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.75
SHROOM2Q13796 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
SHROOM2Q13796 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
SHROOM2Q13796 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
SHROOM2Q13796 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC44.69■■■■■ 4.74
SHROOM2Q13796 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
SHROOM2Q13796 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC44.68■■■■■ 4.74
SHROOM2Q13796 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
SHROOM2Q13796 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC44.66■■■■■ 4.74
SHROOM2Q13796 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
SHROOM2Q13796 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
SHROOM2Q13796 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
SHROOM2Q13796 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
SHROOM2Q13796 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
SHROOM2Q13796 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
SHROOM2Q13796 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
SHROOM2Q13796 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC44.61■■■■■ 4.73
SHROOM2Q13796 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
SHROOM2Q13796 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
SHROOM2Q13796 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
SHROOM2Q13796 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC44.59■■■■■ 4.73
SHROOM2Q13796 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
SHROOM2Q13796 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC44.58■■■■■ 4.73
SHROOM2Q13796 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
SHROOM2Q13796 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
SHROOM2Q13796 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
SHROOM2Q13796 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
SHROOM2Q13796 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
SHROOM2Q13796 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
SHROOM2Q13796 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
SHROOM2Q13796 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
SHROOM2Q13796 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SHROOM2Q13796 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
SHROOM2Q13796 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
SHROOM2Q13796 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
SHROOM2Q13796 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
SHROOM2Q13796 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC44.43■■■■■ 4.7
SHROOM2Q13796 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
SHROOM2Q13796 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
SHROOM2Q13796 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
SHROOM2Q13796 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC44.37■■■■■ 4.69
SHROOM2Q13796 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
SHROOM2Q13796 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
SHROOM2Q13796 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
SHROOM2Q13796 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
SHROOM2Q13796 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
SHROOM2Q13796 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
SHROOM2Q13796 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
SHROOM2Q13796 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC44.32■■■■■ 4.68
SHROOM2Q13796 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
SHROOM2Q13796 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
SHROOM2Q13796 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
SHROOM2Q13796 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC44.28■■■■■ 4.68
SHROOM2Q13796 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
SHROOM2Q13796 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
SHROOM2Q13796 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
SHROOM2Q13796 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
SHROOM2Q13796 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
SHROOM2Q13796 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
SHROOM2Q13796 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
SHROOM2Q13796 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
SHROOM2Q13796 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC44.19■■■■■ 4.66
SHROOM2Q13796 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.66
SHROOM2Q13796 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
SHROOM2Q13796 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
SHROOM2Q13796 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
SHROOM2Q13796 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
SHROOM2Q13796 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
SHROOM2Q13796 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
SHROOM2Q13796 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
SHROOM2Q13796 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
SHROOM2Q13796 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
SHROOM2Q13796 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
SHROOM2Q13796 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
SHROOM2Q13796 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
SHROOM2Q13796 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.65
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