Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
SHROOM2Q13796 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC46.27■■■■■ 5
SHROOM2Q13796 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
SHROOM2Q13796 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC46.26■■■■■ 5
SHROOM2Q13796 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC46.25■■■■■ 4.99
SHROOM2Q13796 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
SHROOM2Q13796 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC46.25■■■■■ 4.99
SHROOM2Q13796 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC46.23■■■■■ 4.99
SHROOM2Q13796 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
SHROOM2Q13796 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC46.17■■■■■ 4.98
SHROOM2Q13796 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC46.15■■■■■ 4.98
SHROOM2Q13796 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC46.15■■■■■ 4.98
SHROOM2Q13796 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
SHROOM2Q13796 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
SHROOM2Q13796 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
SHROOM2Q13796 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
SHROOM2Q13796 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
SHROOM2Q13796 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC46.09■■■■■ 4.97
SHROOM2Q13796 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC46.08■■■■■ 4.97
SHROOM2Q13796 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC46.07■■■■■ 4.97
SHROOM2Q13796 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
SHROOM2Q13796 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
SHROOM2Q13796 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
SHROOM2Q13796 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46■■■■■ 4.95
SHROOM2Q13796 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
SHROOM2Q13796 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.97■■■■■ 4.95
SHROOM2Q13796 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
SHROOM2Q13796 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC45.96■■■■■ 4.95
SHROOM2Q13796 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC45.95■■■■■ 4.95
SHROOM2Q13796 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.94
SHROOM2Q13796 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
SHROOM2Q13796 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
SHROOM2Q13796 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.93
SHROOM2Q13796 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC45.86■■■■■ 4.93
SHROOM2Q13796 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.84■■■■■ 4.93
SHROOM2Q13796 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.84■■■■■ 4.93
SHROOM2Q13796 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
SHROOM2Q13796 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC45.81■■■■■ 4.92
SHROOM2Q13796 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC45.8■■■■■ 4.92
SHROOM2Q13796 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
SHROOM2Q13796 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.78■■■■■ 4.92
SHROOM2Q13796 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
SHROOM2Q13796 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
SHROOM2Q13796 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC45.71■■■■■ 4.91
SHROOM2Q13796 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
SHROOM2Q13796 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
SHROOM2Q13796 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
SHROOM2Q13796 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
SHROOM2Q13796 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
SHROOM2Q13796 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC45.65■■■■■ 4.9
SHROOM2Q13796 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
SHROOM2Q13796 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC45.65■■■■■ 4.9
SHROOM2Q13796 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC45.65■■■■■ 4.9
SHROOM2Q13796 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
SHROOM2Q13796 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
SHROOM2Q13796 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
SHROOM2Q13796 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC45.59■■■■■ 4.89
SHROOM2Q13796 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC45.54■■■■■ 4.88
SHROOM2Q13796 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC45.54■■■■■ 4.88
SHROOM2Q13796 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
SHROOM2Q13796 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
SHROOM2Q13796 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
SHROOM2Q13796 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC45.48■■■■■ 4.87
SHROOM2Q13796 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
SHROOM2Q13796 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC45.47■■■■■ 4.87
SHROOM2Q13796 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.86
SHROOM2Q13796 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
SHROOM2Q13796 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
SHROOM2Q13796 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
SHROOM2Q13796 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC45.4■■■■■ 4.86
SHROOM2Q13796 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
SHROOM2Q13796 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC45.38■■■■■ 4.86
SHROOM2Q13796 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.86
SHROOM2Q13796 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
SHROOM2Q13796 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
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SHROOM2Q13796 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
SHROOM2Q13796 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.27■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
SHROOM2Q13796 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
SHROOM2Q13796 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC45.23■■■■■ 4.83
SHROOM2Q13796 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
SHROOM2Q13796 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
SHROOM2Q13796 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC45.15■■■■■ 4.82
SHROOM2Q13796 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
SHROOM2Q13796 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
SHROOM2Q13796 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
SHROOM2Q13796 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC45.08■■■■■ 4.81
SHROOM2Q13796 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
SHROOM2Q13796 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
SHROOM2Q13796 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
SHROOM2Q13796 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
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