Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
IRF5Q13568 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
IRF5Q13568 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
IRF5Q13568 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
IRF5Q13568 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
IRF5Q13568 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
IRF5Q13568 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
IRF5Q13568 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
IRF5Q13568 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
IRF5Q13568 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
IRF5Q13568 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
IRF5Q13568 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
IRF5Q13568 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
IRF5Q13568 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
IRF5Q13568 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
IRF5Q13568 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
IRF5Q13568 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
IRF5Q13568 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
IRF5Q13568 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
IRF5Q13568 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
IRF5Q13568 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
IRF5Q13568 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
IRF5Q13568 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
IRF5Q13568 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
IRF5Q13568 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
IRF5Q13568 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
IRF5Q13568 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
IRF5Q13568 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
IRF5Q13568 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
IRF5Q13568 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
IRF5Q13568 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
IRF5Q13568 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
IRF5Q13568 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
IRF5Q13568 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
IRF5Q13568 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
IRF5Q13568 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
IRF5Q13568 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
IRF5Q13568 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
IRF5Q13568 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
IRF5Q13568 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
IRF5Q13568 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
IRF5Q13568 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
IRF5Q13568 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
IRF5Q13568 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
IRF5Q13568 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
IRF5Q13568 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
IRF5Q13568 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
IRF5Q13568 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
IRF5Q13568 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
IRF5Q13568 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
IRF5Q13568 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
IRF5Q13568 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
IRF5Q13568 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
IRF5Q13568 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
IRF5Q13568 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
IRF5Q13568 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
IRF5Q13568 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
IRF5Q13568 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
IRF5Q13568 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
IRF5Q13568 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
IRF5Q13568 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
IRF5Q13568 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
IRF5Q13568 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
IRF5Q13568 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IRF5Q13568 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
IRF5Q13568 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
IRF5Q13568 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
IRF5Q13568 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
IRF5Q13568 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
IRF5Q13568 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
IRF5Q13568 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
IRF5Q13568 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
IRF5Q13568 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
IRF5Q13568 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
IRF5Q13568 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
IRF5Q13568 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
IRF5Q13568 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
IRF5Q13568 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
IRF5Q13568 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
IRF5Q13568 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
IRF5Q13568 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IRF5Q13568 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IRF5Q13568 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
IRF5Q13568 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
IRF5Q13568 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
IRF5Q13568 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
IRF5Q13568 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
IRF5Q13568 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
IRF5Q13568 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
IRF5Q13568 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IRF5Q13568 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IRF5Q13568 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
IRF5Q13568 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
IRF5Q13568 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
IRF5Q13568 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
IRF5Q13568 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
IRF5Q13568 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
IRF5Q13568 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
IRF5Q13568 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
IRF5Q13568 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
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