Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCGB2A2Q13296 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCGB2A2Q13296 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCGB2A2Q13296 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCGB2A2Q13296 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCGB2A2Q13296 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCGB2A2Q13296 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCGB2A2Q13296 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCGB2A2Q13296 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCGB2A2Q13296 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCGB2A2Q13296 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCGB2A2Q13296 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCGB2A2Q13296 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCGB2A2Q13296 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCGB2A2Q13296 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCGB2A2Q13296 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCGB2A2Q13296 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCGB2A2Q13296 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCGB2A2Q13296 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCGB2A2Q13296 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCGB2A2Q13296 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCGB2A2Q13296 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCGB2A2Q13296 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCGB2A2Q13296 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCGB2A2Q13296 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCGB2A2Q13296 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCGB2A2Q13296 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGB2A2Q13296 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGB2A2Q13296 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGB2A2Q13296 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGB2A2Q13296 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCGB2A2Q13296 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCGB2A2Q13296 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCGB2A2Q13296 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCGB2A2Q13296 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCGB2A2Q13296 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCGB2A2Q13296 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCGB2A2Q13296 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCGB2A2Q13296 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCGB2A2Q13296 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCGB2A2Q13296 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCGB2A2Q13296 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCGB2A2Q13296 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCGB2A2Q13296 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCGB2A2Q13296 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCGB2A2Q13296 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCGB2A2Q13296 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCGB2A2Q13296 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCGB2A2Q13296 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCGB2A2Q13296 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCGB2A2Q13296 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCGB2A2Q13296 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCGB2A2Q13296 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCGB2A2Q13296 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCGB2A2Q13296 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCGB2A2Q13296 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCGB2A2Q13296 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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