Protein–RNA interactions for Protein: Q13183

SLC13A2, Solute carrier family 13 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A2Q13183 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC13A2Q13183 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC13A2Q13183 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC13A2Q13183 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC13A2Q13183 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC13A2Q13183 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC13A2Q13183 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC13A2Q13183 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC13A2Q13183 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC13A2Q13183 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC13A2Q13183 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC13A2Q13183 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC13A2Q13183 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC13A2Q13183 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC13A2Q13183 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC13A2Q13183 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC13A2Q13183 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC13A2Q13183 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC13A2Q13183 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC13A2Q13183 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC13A2Q13183 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC13A2Q13183 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC13A2Q13183 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC13A2Q13183 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC13A2Q13183 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC13A2Q13183 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC13A2Q13183 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC13A2Q13183 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC13A2Q13183 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC13A2Q13183 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC13A2Q13183 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC13A2Q13183 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC13A2Q13183 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC13A2Q13183 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC13A2Q13183 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC13A2Q13183 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC13A2Q13183 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC13A2Q13183 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC13A2Q13183 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC13A2Q13183 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC13A2Q13183 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC13A2Q13183 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC13A2Q13183 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC13A2Q13183 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC13A2Q13183 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC13A2Q13183 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC13A2Q13183 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC13A2Q13183 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC13A2Q13183 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC13A2Q13183 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC13A2Q13183 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC13A2Q13183 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC13A2Q13183 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC13A2Q13183 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC13A2Q13183 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC13A2Q13183 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC13A2Q13183 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC13A2Q13183 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC13A2Q13183 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC13A2Q13183 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC13A2Q13183 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC13A2Q13183 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC13A2Q13183 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC13A2Q13183 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC13A2Q13183 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC13A2Q13183 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC13A2Q13183 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC13A2Q13183 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC13A2Q13183 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC13A2Q13183 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC13A2Q13183 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC13A2Q13183 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC13A2Q13183 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC13A2Q13183 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC13A2Q13183 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC13A2Q13183 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC13A2Q13183 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC13A2Q13183 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC13A2Q13183 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC13A2Q13183 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC13A2Q13183 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC13A2Q13183 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC13A2Q13183 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC13A2Q13183 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC13A2Q13183 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC13A2Q13183 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC13A2Q13183 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC13A2Q13183 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC13A2Q13183 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC13A2Q13183 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC13A2Q13183 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC13A2Q13183 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC13A2Q13183 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC13A2Q13183 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC13A2Q13183 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC13A2Q13183 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC13A2Q13183 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC13A2Q13183 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC13A2Q13183 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC13A2Q13183 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.7 ms